几个番茄品种AFLP指纹图谱的建立

应用优化的AFLP技术体系,构建了7份番茄黄化曲叶病毒病抗病材料和1份感病材料的指纹图谱。根据所得到的DNA指纹图谱数据,进行亲缘关系和遗传多样性分析。从64对引物中筛选出扩增效果稳定、多态性好的5对引物组合,分别对8份材料的基因组DNA进行扩增,共扩增出清晰的条带149条．其中62条带具有多态性,多态性位点百分率为41．6％。这一结果表明供试抗感黄化曲叶病毒病番茄材料在DNA水平上酶切位点的分布存在一定的差异。供试材料间的遗传相似系数的变化范围为0．83—0．95。以遗传相似系数0．89为阈值,进行UPGMA聚类分析,将8份番茄材料分成1个复合组和3个独立组。以上结果在DNA水平上为番茄抗黄化曲叶病毒病育种的亲本选配提供了参考依据。     

玉米骨干自交系AFLP指纹图谱鉴定

用引物组合EcoRI-AGG/Msel-CAA对我国 19个玉米骨干自交系进行AFLP指纹图谱 ,平均对每个自交系扩增出近 70条带 ,其中近 40条带具有多态性 ,Mo17、A318、ES2 1分别有自己的特征带。结果表明 ,利用AFLP标记总DNA ,能够从基因组上明确区分玉米自交系 ,可以用于玉米自交系种质鉴定     

4个番茄品种及其亲本指纹图谱的构建

采用改良的CTAB法提取番茄4个品种及7份品种亲本的基因组DNA,通过AFLP-PCR分子标记方法进行DNA指纹分析,构建亲本及品种的指纹图谱.从20对引物中筛选出9对重复性好,多态性丰富的AFLP引物来构建番茄指纹图谱,7份亲本材料扩增的多态性位点从10～27条不等,平均每份材料17.56条,多态性位点比例为41.2...     

水稻AFLP指纹图谱的引物选择研究

 通过对适合制作水稻品种AFLP指纹图谱的引物进行研究 ,初步建立了一套快速有效地制作AFLP指纹的引物选择法 :第 1步 ,选择亲缘关系相近的 3组以上材料 ,保证组内材料遗传差异较小 ,组间有一定差异 ;第 2步 ,利用两端相同的 16对 2 +2引物组合选择扩增 ,初步选出具有一定多态性的引物 ;第 3步 ,对具有一定多态性的引物重新组合 ,构成两端不同的 2 +2引物组合 ,选出多态性较高的引物组合 ;第 4步 ,将多态性较高的 2 +2引物的一端增加 1个选择碱基 ,构成 2 +3或 3+2引物组合 ,筛选多态性更强、谱带较多、质量较好的引物组合 ;第 5步 ,随机选择部分品种验证所选引物的有效性。选出了M2 1P87和M73 P17等多态性高、谱带多、带纹清晰的引物组合 ,为水稻品种AFLP指纹图谱制作奠定了基础     

我国芒果主栽品种遗传多样性分析及指纹图谱构建

[目的]研究芒果主栽品种遗传多样性,构建指纹图谱,为芒果品种创新及选育提供理论依据.[方法]利用115对SSR引物对30个芒果品种进行遗传多样性分析和聚类分析,分析其亲缘关系.[结果]从115对SSR引物中筛选出64对多态性引物,扩增条带总数为343条,多态性比例为73.2％.每对引物可检测到等位位点3.9个,基因多样性为0.54,Shannon's信息指数为1.00,多样性信息平均指数为0.49,具有较高的遗传多样性.聚类分析结果表明,可将30份主栽品种分为四大类,第Ⅰ类包括14份材料;第Ⅱ类包括11份材料,主要为国外引种而获得的品种;第Ⅲ类包括4份材料,为缅三、帕拉英达、白玉和红象牙;第Ⅳ类仅有一份材料,为马切苏.选用7对SSR标记M42、M49、M54、M55、M96、M99和M103构建了30份芒果种质的数字化指纹图谱,可完全区分30份芒果主栽品种.[结论]30份芒果材料的基因组遗传较复杂,遗传信息较丰富,具有较高的遗传多样性.     

南瑞苕AFLP指纹图谱的构建与聚类分析

以甘薯生产中主要应用的亲本材料南瑞苕及其子代品种为材料,用建立的AFLP分子标记体系进行研究,筛选得到5对多态性高、分辨力强的引物EATT、MCCA等,通过这5对引物构建出了南瑞苕的指纹图谱。用16对引物对47个与南瑞苕相关的品种进行聚类分析,统计DNA多态性条带后用UPGMA方法获得了聚类分析图,根据结果将47个品种分为5大类型,该实验结果为甘薯育种工作者了解各个品种的相互关系和进一步应用某一材料的优良性状选育品种奠定了基础。     

AFLP标记在两个芒果品种间杂交F_1代的多态性及分离方式

本文利用14对引物组合对AFLP标记在两芒果品种间(Keitt×Tommy)杂交F1代的多态性及分离方式进行的研究结果表明,AFLP标记在该F1代群体中的多态性较高,分离位点出现的平均频率是37.16%.分离方式有孟德尔分离、偏孟德尔分离及异常分离3种方式.3种分离位点出现的平均频率与数量分别为21.13%、149,15.74%、111,2.27%、16,其中孟德尔分离位点占分离位点总数的53.99%.该研究结果可为进一步利用该群体构建芒果AFLP遗传图谱打下良好的工作基础并提供一定的理论依据.     

AFLP标记在两个芒果品种间杂交F_1代的多态性及分离方式

 本文利用 1 4对引物组合对 AFLP标记在两芒果品种间 ( Keitt× Tommy)杂交 F1代的多态性及分离方式进行的研究结果表明 ,AFLP标记在该 F1代群体中的多态性较高 ,分离位点出现的平均频率是 37.1 6%。分离方式有孟德尔分离、偏孟德尔分离及异常分离 3种方式。 3种分离位点出现的平均频率与数量分别为 2 1 .1 3%、1 49,1 5.74%、1 1 1 ,2 .2 7%、1 6,其中孟德尔分离位点占分离位点总数的 53.99%。该研究结果可为进一步利用该群体构建芒果 AFLP遗传图谱打下良好的工作基础并提供一定的理论依据。     

奶山羊间性个体的遗传鉴定及AFLP指纹图谱分析

【目的】分析奶山羊间性个体的遗传背景,探讨间性个体发生的遗传机制,为山羊性别调控以及性别决定的研究提供参考。【方法】通过核型分析、特异性性别调控基因(Sex-determining region of Y chromosome,SRY)的PCR扩增以及AFLP(Amplified fragment length polymorphism)指纹图谱分析等方法,研究西农萨能羊间性个体的遗传本质。【结果】间性山羊与正常母山羊的核型一致,为58+XX;间性个体基因组中未能扩增出SRY基因;AFLP指纹图谱分析发现,有9对引物扩增出清晰的条带,共1 833条,片段长度为70～500bp,9对引物的扩增结果差异明显,表现出丰富的多态性,共获得611个多态位点,占总扩增条带数的33.3%,但在基因组水平上间性山羊与正常母山羊个体并没有大的差异。【结论】根据试验结果推测,间性山羊的出现并非是由个体基因组发生突变造成的,可能是在性别决定过程中某个因子的调控出现差错,从而导致胚胎在发育过程中偏离雌性轨道而产生间性山羊个体,其具体机制有待进一步研究。     

12个蚕豆品种RAPD指纹图谱的构建

对12个蚕豆品种基因组DNA进行扩增,构建蚕豆不同品种的指纹图谱,利用RAPD标记技术.研究结果:42个不同的随机引物中有14个扩增出多态性DNA片段,其中1个引物(S31-CAATCGCCGT)可使每一品种具有其自身的特征谱带.研究结果表明,RAPD技术可从DNA水平上鉴别蚕豆品种的分子差异,用以鉴定品种纯度是可行的.     

亲缘关系相近的梅花品种AFLP DNA指纹分析

该文使用AFLP标记法技术 ,以半同胞家系的‘早凝馨’、‘凝馨’ ,全同胞家系选育出的品种‘美人’梅、‘小美人’、‘俏美人’、‘黑美人’和朱砂型相近梅花品种‘徽州骨红’、‘舞朱砂’、‘小骨里红’共计 9个品种为样本 ,选用 7对引物组合E ACT M CAT、E GA M CTC、E ACT M CCA、E ACT M CAC、E ACT M CAG、E ACC M CAG和E ACT M CTC扩增得到 2 97个多态性位点的条带数据 ,分别选用简单匹配系数和Nei(72 )遗传距离系数 ,进行不加权成对算术平均法聚类分析 ,分别建立了聚类树 .分析结果表明 :AFLPDNA指纹灵敏地鉴别相近品种 ,并与形态学鉴别分类结论相吻合 ,表明DNA指纹鉴定配合形态学鉴定方法具有较高的准确性和有效性 ;聚类分析显示了供试品种间的亲缘关系 ,朱砂型组的 3个供试品种具有比前两个家系更近的亲缘关系 .     

家猪AFLP分析体系的建立

以大白等6个猪品种为试验材料，建立了家猪扩增酶切片段长度多态性(AFLP)分析体系，对其分析过程中DNA提取、双酶切、连接、预扩增、选择性扩增、银染效果进行了检测。用E39M48引物组合构建了供试猪的AFLP指纹图谱。条带清晰可辨，扩增信号强，无背景干扰。     

我国引进萨罗罗非鱼群体的AFLP遗传指纹

应用AELP技术初步分析了我国引进的萨罗罗非鱼群体的遗传指纹特征，8对选择性引物在25个个体中共检测到247个扩增片段，每对引物扩增出的片段数目为27～34，平均扩增片段数目为30．9。群体的平均多态位点比例为16．6％。共检测出25个基因型，每个个体含有独自的基因型。群体内个体间的遗传相似度为0．929～0．995，群体遗传变异较小。本研究结果可为我国萨罗罗非鱼的种质保存与管理提供科学依据。     

我国引进萨罗罗非鱼群体的AFLP遗传指纹

应用AELP技术初步分析了我国引进的萨罗罗非鱼群体的遗传指纹特征,8对选择性引物在25个个体中共检测到247个扩增片段,每对引物扩增出的片段数目为27～34,平均扩增片段数目为30．9。群体的平均多态位点比例为16．6％。共检测出25个基因型,每个个体含有独自的基因型。群体内个体间的遗传相似度为0．929～0．995,群体遗传变异较小。本研究结果可为我国萨罗罗非鱼的种质保存与管理提供科学依据。     

紫薇叶片DNA的提取及AFLP反应体系的建立

以紫薇叶片为材料,利用改进的酚一氯仿法,提取到了高质量的紫薇叶片DNA,并建立了20个紫薇品种和南紫薇的AFLP银染反应体系,首次在紫薇DNA提取、酶切连接、预扩增、选择性扩增等实验过程取得了成功,得到了清晰的紫薇品种的AFLP指纹图谱,为紫薇基因库的建立、优良品种选育以及亲缘关系的系列研究奠定了理论基础．     

苹果AFLP分析体系的建立

以１２个苹果砧枯木基因型为试材,建立了扩增酶切片段长度多态性（ＡＦＬＰ）分析体系,对其分析过程中ＤＮＡ提取、双酶切、连接、预扩增、标记和选择性扩增的效果进行了检测。用Ｐ３２Ｍ６４引物构建了供试苹果砧木基因型的ＡＦＬＰ指纹图谱。该指纹图谱拥有扩增条带１０５条,多态性带６７条（占６３．８％）,条带清晰可辨,扩增信号强,无背景干扰。讨论了ＡＦＬＰ分析的影响因素。     

苜蓿基因组DNA的RAPD指纹图谱

在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和RAPD-PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定的多态性位点的RAPD引物。利用RAPD标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱。筛选的引物扩增条带清晰,具有5～10个多态性位点。利用琼脂糖凝胶电泳可以便捷地检测扩增的DNA多态性。从大量RAPD随机引物中筛选出36个RAPD引物,确定了180多个多态性位点。对几个抗寒苜蓿进行了RAPD分析,构建了55个苜蓿品种(系)的DNA指纹图谱,用于苜蓿品种鉴定。