奶牛育种值估计中方差协方差矩阵元素的求法

在估计奶牛育种值的ＢＬＵＰ法中，综合多方面的信息对育种值作最佳预测，其关键是确定权衡项解的方差协方差矩阵。本文介绍协方差矩阵的求法。１奶牛育种值估计线性模型当利用多种信息，由个体及其亲属的表型值估计育种值时，需要一个ｂｉ来权衡每一个表型值，使估计的精确度达到最高，因此，有线性模型：ＡｄＩ＝ΣｂｉＰｊ＋ｅ１这里，ＡｄＩ为个体直接加性效应ｂｉ为回归系数Ｐｊ为具有亲缘关系的个体表型记录ｅ为剩余项回归系数ｂ的最小二乘方程是：Ｖｂ＝ＲＨＳ其中，Ｖ是个体及其亲属的方差协方差矩阵；ｂ为回归系数向量；ＲＨＳ…     

牛常见遗传病的遗传基础和检测方法

遗传疾病指由于遗传物质变异引起的身体或生理缺陷,可以由亲代传递给后代.人工授精技术在奶牛育种中的广泛使用使得遗传疾病传播的危险性大大增加.因此,研究奶牛遗传疾病的遗传基础和检测方法具有重要意义.     

优秀青年公牛使用的重要性

牛群的育种工作是牛群改良的基础，也是牛群经济效益的关键所在。我们在奶牛育种中，不论实施什么样的育种措施，其最终目的是，通过系统的选择使得育种群每年稳定地获得累积性遗传进展，而这遗传进展快慢与使用优秀青年公牛有密切联系。 从遗传育种学理论分析，影响遗传进展的快慢有四个因素，其关系如下： 　△Ｇ＝ＩＱＡ·ＲＡＩＴ 　△Ｇ代表每年的遗传进展 ｉ代表选择强度 ＱＡ代表遗传变异度 ＲＡ．Ｉ代表育种值谁确性 Ｔ代表世代间隔１　加大选择强度（ｉ） 奶牛场一般都执行“见母就留”的原则，不进行主动的淘汰，所以母牛的选择强…     

美国奶牛遗传改良计划(上)

近年美国奶牛产奶量的遗传改良速度在提高。1986年出生的黑白花母牛的奶量育种值比1985年出生的约高135kg。每年有220多万头母牛的新数据加入生产性能遗传评价体系。这些评定应用动物模型,能够提供产奶量、乳脂量、乳蛋白量、乳脂率以及乳蛋白率遗传传递力的最佳线性无偏预测。模型包括管理组效应、永久环境效应、牛场与公牛的互作效应以及奶牛个体的遗传值。未知父母组按出生年度和性别确定,代表基础群的遗传值。体型评定资料由品种协会收集,用公畜模型评定。黑白花母牛的体型应用全部体型评分和多性状模型评定,其他品种则利用全部评分资料配合单性状重复力模型计算。难产性资料由人工授精组织和奶牛记录处理中心收集,用依阿华州立大学的阈性状公畜模型分析,得到美国国家家畜育种者协会支持。增加选留的青年公牛数,应用超数排卵和胚胎移植提高公牛母亲的选择强度,用低胎次母牛或青年母牛作公牛母亲缩短世代间隔等是提高遗传改良速度的手段。在这些方面人工授精组织有特别重要的作用。国际贸易是人工授精计划的一个重要经济来源。将来评定的性状可能还包括乳房炎抗性、长寿性和受精率等,评定的次数可能更多。模型中还可能考虑其他影响因素。     

美国奶牛生产性状和体型外貌性状的遗传评定

美国对奶牛生产性能和体型外貌性状的遗传评定采用的是动物模型计算方法，动物模型是计算预期传递力（PTA）最先进的方法。体型外貌性状的遗传评定由美国荷斯坦奶牛协会承担，生产性能的预期传递力、体细胞评分、生产年限和净价值（NetMerit）的计算则由美国农业部家畜改良计划实验室（USDA－AIPL）进行。动物模型的评定方法是根据动物个体与其它评定的个体的亲缘关系来进行的。动物个体本身、祖先和后代的信息，与被评定个体间的所有已知亲缘关系信息综合到一起，并利用了母系信息，包括母系祖先信息和母系后裔信息。在动物模型的遗…     

BLUP法在肉羊育种中的应用初探

用ＢＬＵＰ法计算种羊衣种值并与后裔测定值以及后代公羊的表型值作比较，结果种公羊的育种值评定与后裔测定相关达到显著水平，可以认为ＢＬＵＰ法适用于肉羊的遗传评定。     

国际奶牛基因组选择的发展概况

二十一世纪初,基因组选择(Genomic Selection,GS)技术给传统奶牛育种体系带来新的活力。该方法利用基因芯片技术实现规模化的SNP标记多态检测,基于各国积累的大量后裔测定遗传评估结果,实现单个遗传标记或多个遗传标记构成单倍型的遗传效应估计。基因组选择的方法仅利用新生后备种公牛的基因组检测信息,即可实现动物个体的基因组育种值(GEBV)估计,据研究报道,其可靠性高于传统的系谱选择,最高可达75%左右。基因组选择策略实现乳用种公牛的早期选择,极大缩短了奶牛遗传改良的世代间隔,节约选育成本,提高选育效率,目前已在多个奶业发达国家具体实施并公开发布评定结果。本文对国际奶牛基因组选择的发展概况进行归纳综述。     

水貂的数量性状育种(第三讲)

<正> 本讲将在数量遗传学的基础上分析选择的育种作用。 一、什么是选择 简单地说,就是留种时的“选优去劣”。在经常的饲养工作中,一般称之为选种。 从前两讲中已经知道,任何一个数量性状的表型值都是由基因型值和环境离差两部分组成的。环境离差不能遗传,在基因型值中能真实地遗传给后代的是加性基因值,即育种值。根据这个原理,选择不应     

传统的种猪育种原理及选种方法

一、育种原理1.确定育种目标目标的着眼点是经济效益最大值。AT=∑AiWi,式中的AT为综合育种值,Ai为性状i的育种值,Wi为性状i的经济加权系数。对于数量性状的育种,需考虑两个问题,一是目标性状,二是目标性状的经济加权值。2.利用加性遗传效应基因的传递过程中,加性效应是相对稳定的。加性效应值就是性状的育种值。这就要通过选择来获得加性效应的遗传进展。为此需要3个基本条件:(1)性状有变异。群体内变异幅度越大,获得的选择反应也越大。(2)变异是可以遗传的。有些变异是环境因素造成的,选择不会产生作用。相反,表型值变异中加性遗传效…     

青贮酶制剂

应用于青贮制作中的酶包括纤维素酶、半纤维素酶、果胶酶和淀粉酶，当酶起作用时，酶制剂能够增加青贮窖中可发酵糖的供应量，因此当底物缺乏时，它能延长发酵过程，结果使青贮ｐＨ值降低和剩余糖含量增量、增加结构性碳水化合物代谢能含量以及促进瘤胃中依赖非结构性碳水化合物的细菌生长，这些作用可以从分析饲料中ＮＤＦ中性洗涤纤维和ＡＤＦ酸性洗涤纤维含量降低之结果得以证明。在禾本科饲草青贮中，已观测到ＮＤＦ降低１～５％；当青贮时间较短时２７天贮存期，没有观测到纤维素和半纤维素含量变化；ＡＤＦ降低和ＮＤＦ下…     

Guidelines For Uniform Swine Improvement Programs(2002-2003)

2遗传学原理 2.1通过选择取得遗传进展 选择(Selection)是一个只允许部分群体用于繁殖的定向过程.如果被选择个体的某一性状的遗传性能优于群体的平均值,那么其后代的这一性状的性能也有希望高于平均水平.选择的原理就是双亲与后代之间的遗传相似性.每一个亲本都会将其一半的基因随机地传递给后代,后代的遗传性能由双亲的遗传天性或育种值决定.     

北京地区荷斯坦牛体型性状遗传参数估计和部分性状间表型相关的分析

遗传参数是指导动物改良育种工作的科学依据。奶牛体型线性评定方法的研究估计了线性体型性状的遗传力，以评估选择对体型的重要性。本文拟利用北京市采用线性鉴定方法以来所收集的数据，对线性鉴定的性状的遗传力进行估计，并对部分性状间的表型相关进行分析，用以指导实...     

关于“家畜复合育种值简化公式”中系数的讨论

<正> 在对家畜数量性状的选择中,应用表型值选择往往不够准确。因为数量性状的表型值都是在遗传与环境两方面作用的结果。如奶牛的产奶量,除决定于本身的遗传原因,很大程度上决定于饲养管理条件。如果根据育种值进行选择则较为准确。育种值的估计,依资料的来源不同而分为:1.根据本身成绩估计育种值。2.根据祖先成绩估计育种值。3.根据同胞成绩估计育种值。4.根据后代成绩估计育种值。5.根据几方面资料来源估计复合育种值。     

利用后裔测定验证大白猪基因组选择实施效果研究

旨在通过测定基因组选择选留的大白公猪的后裔生产性能,探究基因组选择实际育种效果。本研究选用913头大白猪构建参考群体,利用ssGBLUP对新出生的823头大白公猪在去势前进行第一次基因组评估,待生产性能测定后进行第二次基因组评估,最终选留10头性能差异显著的公猪留种,比较其后代生长性状表型和育种值及综合选择指数差异。结果表明,两次基因组遗传评估,达100 kg体重日龄、100 kg活体背膘厚和总产仔数3个性状基因组育种值（GEBV）估计准确性分别由0.56、0.67和0.64提高至0.73、0.73和0.67,两次基因组选择基因组母系指数相关系数为0.82,表明在去势前进行公猪基因组选择具有较高的准确性,可实现种猪早期选择。根据各性状GEBV和基因组母系指数,10头公猪被划分为高、低生产性能组,后裔测定成绩表明,两组公猪后代100 kg体重日龄表型均值之差为2.58 d,育种值之差为3.08 d,100 kg活体背膘厚表型均值之差为1.15 mm,育种值之差为1.03 mm,综合母系指数均值之差为9.3,除后代100 kg体重日龄表型均值之差外,其他差异均达到极显著水平。本研究证明,在基因组评估中具有显著差异的公猪其后代在表型值和育种值等方面均存在显著差异,通过基因组选择能够挑选出优秀种公猪,可将其遗传优势传递给后代。     

奶牛乳腺炎抗性的遗传学研究与应用

奶牛乳腺炎是威胁奶牛业健康发展的主要疾病之一,在世界范围内造成巨大损失,各国相继将乳腺炎抗性纳入奶牛育种目标。本文综述了奶牛乳腺炎抗性的表型特性、主要遗传参数及其与其它性状的遗传相关;总结了近年来关于奶牛乳腺炎抗性的分子遗传学研究成果及遗传工程的应用概况;对于未来的奶牛乳腺炎抗性选育,应实施完善表型标记、多分子标记聚合应用的研究;尽快建立我国牛奶测定系统、将乳腺炎抗性纳入奶牛育种目标应是当务之急。     

美国奶牛遗传改良计划(下)

遗传信息在奶牛改良中的应用遗传评定资料在决定奶牛的价值、确定重点使用的公牛、制定后代培育计划等方面有重要作用。生产与体型性状的评定结果,于每年1月和7月发布给育种者和人工授精组织。人工授精组织应用这些结果决定公牛使用与否,制定精液价格。难产性评定结果只在每年7月公布一次。从最近产犊的母牛中挑选生产性状最高的1%制订成册,标明哪些可以选为公牛母亲,尤其适合进行胚胎移植处理。黑白花奶牛协会公布 TPI 最高的10000头母牛。现在大多数青年公牛(1988年出生的黑白花公牛中71%)由胚胎移植产生,因为通过胚移从个体的选配计划中得到公犊的可能性很高。1990年 TPI 最高的100     

宁夏地区荷斯坦奶牛遗传参数估计

利用2008-2016年出生的27 444头宁夏地区荷斯坦奶牛生产性能（dairy herd improvement,DHI）数据及体型线性评分数据计算乳脂率（fat percentage,FP）、乳蛋白率（protein percentage,PP）、体细胞评分（somatic cell score,SCS）、305 d产奶量（milk yield of 305 days,MYD）、初产日龄（age at first calving,AFC）、产犊间隔（calving interval,CI）和体况评分（linear classification scores,LCS）的遗传参数。利用DMU v 6.0软件,采用AI-REML模块结合EM算法并配合多性状动物模型,以季节、场、年份、胎次和动物个体加性遗传效应作为模型的影响因素。计算结果表明,宁夏地区奶牛的FP、PP、SCS、MYD、AFC、CI和LCS的遗传力分别为0.14、0.19、0.19、0.31、0.37、0.10和0.07,同时得出了奶牛不同性状的育种值、遗传相关和奶牛生产性能指数2（China performance index 2,CPI2）值。本研究通过对宁夏地区奶牛DHI数据的深挖和遗传评估,准确地把握了宁夏奶牛群体结构特征,对于奶牛的选种选配、育种规划和选择指数的构建有重要意义。     

奶牛性别控制技术概述

性别控制是通过对动物的正常生殖过程进行人为干预,使母畜按照人们的愿望所需性别后代的繁殖技术。通过控制奶牛性别不仅可以增强奶牛选择强度,提高繁殖力,加快遗传育种进程,还能促进奶牛向质量型发展,对奶牛业发展具有十分重要的意义。     

我国奶牛遗传病发展现状

<正>奶牛遗传病是指由奶牛遗传物质发生改变引起的可以由亲代传递给子代的疾病,近年来,随着我国奶业发展水平的不断提升,奶牛品种改良进程也在不断加快,在对奶牛遗传性状的不断优化和改良过程中,人工授精等技术得到广泛应用,奶牛的近交系数不断增大,从而造成奶牛遗传病的发生随之愈演愈烈,目前我国正处于奶业发展的重要时期,亟需加快推进奶牛良种化进程,奶牛遗传病的存在严重影响奶牛的遗传进展,阻碍我国奶业健康发展。     

中国从加拿大奶业网引进奶牛测定日模型遗传评估系统已开始启用

中国农业大学、中国奶业协会联合与加拿大奶业网（CDN）于2006年在北京签署了奶牛测定日模型遗传评估系统的引进协议。2007年中国奶业协会已应用此系统对部分有后裔测定成绩的种公牛进行了个体遗传评估．这标志我国奶牛遗传评估系统已有新的突破。传统动物模型奶牛遗传评估系统存在一定的缺陷，主要包括需要通过测定日记录估计泌乳期记录，估计的过程本身存在较大的误差：对只作用于一定泌乳阶段的系统环境效应．无法在模型中直接考虑：假设性状的育种值在一个泌乳期内保持不变等。为解决上述问题．1993年加拿大圭尔夫大学著名教授Larry Schaeffer首次提出了测定日模型．其原理是利用奶牛泌乳测定日记录直接估计奶牛泌乳测定日育种值，进而得到泌乳期育种值。目前世界上奶业发达国家加拿大、德国、荷兰等国家均采用测定日模型对奶牛进行个体遗传评定。