基于代谢组学分析平菇栽培用培养料发酵过程中代谢物的变化

为了解发酵培养料制备过程中微生物代谢产物的组成和变化规律,采用非靶向代谢组学技术,检测分析发酵2、4、6、8和10 d时培养料的代谢组数据.结果表明:在正离子(POS)模式下,分别在T2 vs T1、T3 vs T2、T4 vs T3和T5 vs T4中筛选得到331、145、161和115种差异代谢物;在负离子(NE...     

基于广泛靶向代谢组学的瓠瓜果实鲜味差异代谢物分析

采用超高效液相色谱串联质谱(UPLC-MS/MS)技术,对2个口感品尝鲜味差异显著的瓠瓜品系I77和Nanxiu进行广泛靶向代谢组学研究.结果表明,不同瓠瓜品系果实间存在较大的代谢物差异,共筛选到66种显著差异物质,通过对I77与Nanxiu差异代谢物的聚类热图比较、差异倍数(Fold change,FC≥4)分析、主...     

平菇菌丝体生长代谢调控的研究进展

从培养基的配方、微量元素的添加、工业废料的利用、植物生长调节剂的调节、农药的应用、环境污染和辐照因素等方面,综合论述了近几年来人们对平菇菌丝体生长代谢影响因素的研究进展。     

壳聚糖对平菇菌丝体生长代谢的影响

以平菇为材料,研究在不同质量浓度(0.125、0.083、0.063、0.05 mg/mL)的壳聚糖的条件下对茵丝体生理生化的影响.结果表明:不同质量浓度的壳聚糖对平菇菌丝体的生长代谢均具有促进作用,但随添加壳聚糖浓度的不同而有所不同.其中以0.083mg/mL的壳聚糖促进作用最为明显,可以使茵丝体干重增加33.3%,蛋白质含量、可溶性糖含量及核酸含量分别增加34.72%、36.33%和39.53%,0.125 mg/mL和0.063 mg/mL的壳聚糖稍次之,0.05 mg/mL的壳聚糖影响不明显.     

粒径对平菇栽培用玉米芯发酵料代谢物的影响

为了解玉米芯粒径对平菇栽培用发酵料中代谢物的影响,采用代谢组学技术分析添加不同粒径玉米芯的发酵料中微生物代谢物及其代谢通路.结果表明,添加小粒径玉米芯(D50=0.5 cm)和大粒径玉米芯(D50=1.5 cm)的发酵料中微生物代谢物差异显著.在正离子(POS)和负离子(NEG)模式下分别筛选得到464种和201种差异...     

不同浓度壳聚糖对平菇菌丝体生长代谢的影响

壳聚糖是甲壳素经脱乙酰基而得到的高分子阳离子聚合物，具有特殊的分子结构与功能，在科研及应用领域越来越受到人们的重视。研究以平菇为材料，试验研究在不同质量浓度（0．125mg/mL，0．083mg/mL、0．063mg/mL、0．05mg/mL）的壳聚糖的对平菇菌丝体生理生化的影响。结果表明：不同浓度的壳聚糖对平菇菌丝体的生长代谢均具有促进作用，但不同添加浓度作用有所不同，其中以0．083mg/mL的壳聚糖促进作用最为明显，可以使菌丝体干重增加33．3％，蛋白质含量、可溶性糖含量及核酸含量分别增加34．72％、36．33％和39．53％，0．125mg/mL和0．063mg/mL的壳聚糖稍次之，0．05mg／mL的壳聚糖影响不明显．     

杏鲍菇菌丝体与子实体氨基酸的组成分析

杏鲍菇（Pleurotus eryngii）又名刺芹侧耳,子实体口感脆嫩,味道鲜美,含多糖、多肽、三帖等活性物质,有提高机体免疫力、整肠美容的功能,是一种珍贵的药食皆宜的真菌,被列为21世纪最具开发潜力的食用菌之一[1,2,3]。     

平菇菌丝体生长速度与子实体产量的相关性研究

应用生物统计学的方法 ,对 7个供试平菇菌株的菌丝体生长速度与子实体产量进行了相关性分析。结果表明 :母种菌丝体生长速度与子实体产量相关性不显著 ;原种菌丝体生长速度与子实体产量呈负相关性 ;第一潮菇产量与总产量相关性不显著     

基于代谢组学的不同品种芍药根系次生代谢产物差异表达分析

以不同芍药品种为试材,采用甲醇漩涡法进行次生代谢产物的提取,超高效液相色谱串联质谱(UPLC-MS/MS)进行成分的分离和鉴定,基于代谢组学进行差异鉴别分析,并基于本地代谢数据库的自建MWDB数据库(Metware Database),对原始数据进行筛选,对不同品种芍药的代谢物进行质控分析、主成分分析、正交偏最小二乘法、聚类分析和样品重复相关性评估,研究了3种芍药品种次生代谢产物之间的差异,以期为进一步对芍药药用价值的研究、栽培育种及遗传改良提供参考依据。结果表明：3个芍药品种中鉴定出萜类、生物碱类、酚酸类、鞣质、木质素和香豆素类共五大类464种次生代谢物;由主成分和偏最小二乘判别分析可知3个芍药品种间的次生代谢物差异明显;差异代谢物的筛选共得到3个品种间显著差异代谢物53种(上调26,下调27);利用KEGG数据库共注释到194条差异代谢途径,富集到次生代谢产物生物合成、苯丙氨酸代谢、烟酸和烟酰胺代谢、糖酵解代谢和苯并恶嗪类生物合成共5条生物合成途径。“红色魅力”“大富贵”“粉玉奴”的次生代谢物的种类和含量存在较大差异,3个芍药品种次生代谢产物差异显著,其中“粉玉奴”适合作为药用品种...     

香菇子实体发育过程中的转录组研究

对香菇子实体发育过程中不同阶段及组织(菌盖和菌柄)进行转录组测序,分析了差异表达基因、基因表达趋势、基因共表达网络及差异可变剪接事件.分析结果表明:在转色菌丝体阶段,大量碳水化合物代谢相关基因上调表达;此外,光受体等信号转导相关基因以及黑色素合成相关基因也上调表达,其可能参与到菌丝转色过程.原基形成过程可能涉及与环境因...     

工厂化栽培海鲜菇菌包的代谢产物动态变化特征

以工厂化栽培海鲜菇菌包为试材,采用韦恩分析、偏最小二乘判别分析、聚类分析和通路富集分析等方法,利用非靶向代谢组学研究不同培养时期海鲜菇菌包的代谢产物动态变化特征,分析不同培养时期海鲜菇菌包的代谢产物,以期为阐明海鲜菇代谢调控机制和优化海鲜菇菌包提供参考依据。结果表明：不同培养时期海鲜菇菌包共鉴定出3 205种代谢产物,其中不同培养时期海鲜菇菌包中均共有代谢产物1 844种(87.4%),主要包含羧酸及其衍生物、脂肪酰基、有机氧化合物、异戊醇脂质等物质。代谢途径富集分析表明,氨基酸类代谢、碳水化合物代谢、辅因子和维生素的代谢、核苷酸代谢、脂质代谢等途径占据主导地位。通过与对照(未接种菌包)相比,筛选出121种差异代谢物,隶属于15条代谢途径,其中赖氨酸生物合成,辅因子的生物合成,核黄素代谢,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成,泛酸和辅酶A生物合成,硫胺素代谢等6条代谢途径表现出显著性差异(P<0.05),它们主要属于氨基酸类和B族维生素类代谢产物,而且这些代谢途径对海鲜菇子实体、营养物质和鲜味形成具有重要影响。不同培养时期海鲜菇菌包代谢产物表现出明显差异,表现出培养早期(Hm2)和出...     

木质纤维素的降解和五种酶的活性对香菇子实体形成的影响

本文从生化角度研究了F型(形成子实体)和N型(不形成子实体)两类香菇菌株在生长发育过程中生化代谢活动上的差异。结果表明,在香菇的整个生长过程中,F型菌株的纤维素酶、半纤维素酶、漆酶、酸性蛋白酶和果胶酶的活性均高于N型菌株,尤其在形成子实体的第二和第三阶段,纤维素酶、半纤维素酶和酸性蛋白酶的活性均呈较大幅度的增加,这种趋势与胞外可溶性蛋白含量的增幅是一致的,同时F型菌株对培养基中木质素、纤维素和半纤维素的降解能力也高于N型菌株,说明在形成子实体的过程中,F型菌株具有比N型菌株相对更强的生化代谢能力;各种与物质降解有关酶的代谢活动在某些环节上受阻或不能有效地表达是N型菌株不能形成子实体的一个重要生理原因。     

干旱胁迫下大蒜幼苗的代谢组学分析

利用高效液相色谱串联质谱广泛靶向代谢组学的方法，通过主成分分析、正交偏最小二乘判别分析、聚类分析、富集分析、相关性分析等方法，测定并比较干旱胁迫和对照大蒜幼苗叶片的代谢物质成分。结果共检测出23类743种代谢物，其中313种上调，430种下调，差异代谢物134种，占总体代谢物的18.03%。上、下调差异代谢物质数量最多的为黄酮、苯丙素、黄酮醇、黄酮类、核苷酸及衍生物、氨基酸及衍生物、糖类、有机酸及衍生物等8类物质，主要富集在黄酮和黄烷酮的生物合成途径中，干旱胁迫后大蒜幼苗叶片黄酮差异代谢物数量较多且上调。对大蒜黄酮代谢途径进行分析，咖啡酸和麦黄酮O–丙二酰己糖苷的上调关联代谢物质最多，推测干旱胁迫下黄酮和苯丙素物质含量的增加会显著提高大蒜的抗旱性。     

代谢组学技术在果实采后生理研究中应用的研究进展

代谢组学是对生物体内代谢物组的含量或变化进行测定,进而研究生物体的整体功能状态的技术。在介绍代谢组学相关概念的基础上,重点介绍了代谢组学研究过程中的样品提取、分析技术和数据分析的常用方法,并对该技术在果实采后生理和病理方面的研究进展进行了综述,最后对该技术目前存在的问题和发展趋势进行了分析和展望,以期促进代谢组学技术在果实采后生理研究中的应用。     

基于广泛靶向代谢组学研究板栗皮儿茶素类物质消化前后的组成变化

作为板栗加工的副产物,板栗皮含有以儿茶素类物质为代表的多酚化合物,具有抗氧化、抑菌以及抗肿瘤等作用.为研究板栗皮中活性物质的生物利用率,本文采用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)的广泛靶向代谢组学技术,研究了板栗皮儿茶素类物质经过模拟消化体系后的组成变化.无监督模式识别的主成分分析(PCA)结果表明,消化...     

CO2对金针菇子实体发育的影响及在冷库生产中的控制

由于近年果品销售不景气,河北省赵县、宁晋、晋州等梨产区的大量贮梨冷库处于闲置状态或产生闲置期。受灵寿、正定、行唐等地生产金针菇的影响,许多库主开始利用贮梨冷库进行白金针菇的反季节生产,但极易发生产量低、菇体商品性状差等问题。在影响金针菇生长的温度、湿度、光照     

菜豆豆荚发育过程中内源激素与细胞壁代谢的关系

细胞壁代谢严重影响鲜食菜豆(PhaseolusvulgarisL.)的食用品质。以‘大白棒’豆荚为试材,研究其4个发育阶段内源激素含量、细胞壁主要成分及酶活性的变化,并分析其内源激素与细胞壁代谢的关系。结果表明,豆荚发育过程中GA3和6-BA含量呈下降趋势,乙烯(ET)生成速率和茉莉酸(JA)含量呈先降后增趋势;豆荚在花后前10d以增长为主,花后10d后以增粗为主;花后前10d蔗糖合成酶(SuSy)促进蔗糖合成,随着SuSy活性和纤维素酶(Cx)活性的下降,蔗糖含量降低,纤维素含量升高;花后5 d时G木质素在木质部沉积,花后10 d时G木质素和S木质素均在韧皮部沉积,逐渐增多并向两边扩散,S木质素仅在韧皮部沉积;花后5 d时苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性高,为木质素生物合成提供底物,随后肉桂醇脱氢酶(CAD)活性增加,促进木质素合成;超氧化物歧化酶(SOD)活性增加促进O₂^-向H₂O₂转化,与增加的过氧化物酶(POD)催化木质素的氧化聚合;多聚半乳糖醛酸酶(PG)活性、共价性果胶(SSP)和水溶性果胶...     

‘纽荷尔’脐橙果实发育过程中几种柠檬酸代谢相关基因的表达特征分析

【目的】探讨‘纽荷尔’脐橙果实发育过程柠檬酸变化规律及其与相关基因表达的关系。【方法】以赣南脐橙‘纽荷尔’为材料,利用高效液相色谱法(HPLC)测定了脐橙果实中有机酸组分的变化规律并采用实时定量PCR(Q-PCR)分析了柠檬酸代谢相关基因的相对表达量。【结果】‘纽荷尔’脐橙果实有机酸以柠檬酸为主,奎尼酸次之,苹果酸最少。伴随着果实发育成熟,柠檬酸、奎尼酸和酒石酸含量则呈下降的趋势,总有机酸及可滴定酸的变化趋势与柠檬酸的变化趋势一致;Cit CS1的转录丰度呈现不规则的表达模式,而Cit CS2的转录丰度变化不大,中期略有下降,呈现相对稳定的表达模式;Cit Aco1呈前期低丰度表达,后期高丰度表达,而Cit Aco2从盛花后60 d到成熟呈平稳上升趋势,伴随果实发育,Cit Aco3相对表达量变化幅度较大,总体上呈现先升后降的趋势;果实中Cit IDH1和Cit IDH3的相对表达量呈平稳上升的态势,而Cit IDH2的相对表达量在整个发育阶段比较低;Cit GAD4呈高丰度表达的态势,且变化幅度比较大,在盛花后120 d相对表达量达到最大值,但果实中Cit GAD5的相对表达量一直较低,且伴随果实成熟呈下降趋势;脐橙果实中Cit GS2表达水平略低,在整个发育阶段呈现先平稳上升再平缓下降的趋势,变化幅度不大。【结论】随着‘纽荷尔’脐橙果实发育成熟,柠檬酸降解,总有机酸含量下降,这种变化与柠檬酸合成无直接关联,而对降解相关基因的表达有所影响,尤其是Cit Acos、Cit IDH1、Cit IDH3与Cit GAD4的表达水平随着柠檬酸的下降而不断升高,可能是影响‘纽荷尔’脐橙果实成熟过程有机酸含量不断下降的原因之一。