| 豚鼠ESR2基因新的可变剪接体克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 司景磊,李龙,陈秋明,郭晓萍,郭亚芬,蒋钦杨. 豚鼠ESR2基因新的可变剪接体克隆及序列分析[J]. 南方农业学报, 2016, 47(5): 731-735. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.05.731 |
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| 作者姓名： | 司景磊 李龙 陈秋明 郭晓萍 郭亚芬 蒋钦杨 |
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| 作者单位： | 广西大学动物科学技术学院,南宁,530005 |
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| 基金项目： | 南宁市科学研究与技术开发计划项目(20132099) |
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| 摘 要： | ![]()
[目的]对豚鼠雌激素受体2(ESR2)基因进行克隆及序列分析,并预测分析其编码的蛋白序列,为提高豚鼠产仔性能及其育种打下基础.[方法]根据GenBank已公布的豚鼠ESR2基因序列(登录号XM003472337)设计引物,以豚鼠卵巢组织总RNA为模板,RT-PCR扩增ESR2基因编码区序列(CDS),利用生物信息学分析其编码蛋白氨基酸的组成及理化性质、二级结构及与相关物种的同源性.[结果]克隆获得的豚鼠ESR2基因CDS长度为1650bp,编码549个氨基酸,比参照序列(XM 003472337)少54个碱基,是ESR基因新的可变剪接体,且第7外显子缺失;蛋白质二级结构预测结果表明,豚鼠ESR2成熟肽包含α螺旋、β折叠和无规卷曲3种二级结构元件,由于缺失18个氨基酸导致蛋白质结构发生变异;同源性分析结果显示,豚鼠与长尾龙猫、奥氏更格卢鼠、马、达马拉鼹鼠、裸鼢鼠、鼠狐猴、八齿鼠、猪和人的ESR2基因序列同源性分别为91%、87%、86%、91%、92%、86%、88%、92%和86%.[结论]克隆获得的豚鼠ESR2基因为新的可变剪接体,可作为研究豚鼠产仔性能及豚鼠育种重要的候选基因之一.
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| 关 键 词： | 豚鼠 产仔性能 ESR2基因 克隆 序列分析 |
Cloning and sequencing for new alternative splicing of ESR2 gene in Cavia porcellus |
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| SI Jing-lei,LI Long,CHEN Qiu-ming,GUO Xiao-ping,GUO Ya-fen,JIANG Qin-yang. Cloning and sequencing for new alternative splicing of ESR2 gene in Cavia porcellus[J]. Journal of Southern Agriculture, 2016, 47(5): 731-735. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.05.731 |
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| Authors: | SI Jing-lei LI Long CHEN Qiu-ming GUO Xiao-ping GUO Ya-fen JIANG Qin-yang |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | Cavia porcellus farrowing performance ESR2 gene clone sequence analysis |
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