| 利用cDNA-AFLP分析内生解淀粉芽胞杆菌 Fy11诱导辣椒差异表达基因 |
| |
| 引用本文： | 杨瑞先,范晓静,邱思鑫,蔡学清,胡方平. 利用cDNA-AFLP分析内生解淀粉芽胞杆菌 Fy11诱导辣椒差异表达基因[J]. 中国农业科学, 2013, 46(12): 2449-2458. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.12.006 |
| |
| 作者姓名： | 杨瑞先 范晓静 邱思鑫 蔡学清 胡方平 |
| |
| 作者单位： | 1. 福建农林大学植物保护学院,福州,350002
2. 福建省农业科学院作物研究所,福州,350002 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（30671463）、福建省发改委项目（KY0030060） |
| |
| 摘 要： | 【目的】分析内生解淀粉芽胞杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）Fy11诱导辣椒（Capsicum annuum）幼苗差异表达基因，了解辣椒与内生芽胞杆菌互作的分子机制。【方法】利用cDNA-AFLP技术，采用256对引物，分析辣椒幼苗接种内生解淀粉芽胞杆菌Fy11后5个时间点的基因表达谱；利用qRT-PCR分析差异基因表达模式，验证cDNA-AFLP表达谱。【结果】256对引物共产生18 620个转录本（TDF），筛选获得353条差异表达条带，占扩增条带总数的1.89%。经克隆、测序分析，最终获得257个差异TDF，聚类分析得到229个独立基因（EST，unigenes），其中144个基因上调表达，85个基因下调表达。经Blastx比对和功能分类分析，其中65条EST（28.38%）未找到同源性匹配，8条（3.49%）与未知功能蛋白同源性较高。其余156条EST主要涉及基础代谢基因（10.92%）；与能量和抗病与防御类相关基因，各占8.73%；信号转导基因占7.42%；转运子或转座子基因占6.99%；与细胞结构相关基因占6.55%；参与转录调控基因占5.68%；细胞生长类基因占3.93%；参与蛋白质运输和储存有8个基因，占3.49%；蛋白质合成类基因占2.18%；次生代谢类和胞间运输类基因，其数量相对较少，各占1.75%。选取与抗病防御、转录调控及信号转导类等相关的10个差异基因，qRT-PCR分析结果显示其表达模式符合cDNA-AFLP表达谱。【结论】内生细菌与植物互作的分子机制涉及植物多方面生理生化反应，包括抗病防御、转录调控、蛋白质代谢、信号转导、以及非生物胁迫等多种途径相关基因的协同控制。
|
| 关 键 词： | 辣椒 内生解淀粉芽胞杆菌 互作 基因表达 cDNA-AFLP qRT-PCR |
| 收稿时间： | 2012-12-25 |
cDNA-AFLP Analysis of Differential Gene Expression in Pepper Inoculated with Endophytic Bacillus amyloliquefaciens Fy11 |
| |
| YANG Rui-Xian,FAN Xiao-Jing,QIU Si-Xin,CAI Xue-Qing,HU Fang-Ping. cDNA-AFLP Analysis of Differential Gene Expression in Pepper Inoculated with Endophytic Bacillus amyloliquefaciens Fy11[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2013, 46(12): 2449-2458. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.12.006 |
| |
| Authors: | YANG Rui-Xian FAN Xiao-Jing QIU Si-Xin CAI Xue-Qing HU Fang-Ping |
| |
| Affiliation: | 1.College of Plant Protection, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002;2.Institute of Crop Sciences, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350002 |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Capsicum annuum Bacillus amyloliquefaciens interaction gene expression cDNA-AFLP qRT-PCR |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国农业科学》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中国农业科学》下载全文 |
