| 玫瑰查尔酮合酶CHS基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 齐 宇,赵兰勇. 玫瑰查尔酮合酶CHS基因的克隆及生物信息学分析[J]. 农学学报, 2015, 5(11): 91-96 |
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| 作者姓名： | 齐 宇 赵兰勇 |
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| 作者单位： | 山东农业大学林学院,山东农业大学林学院 |
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| 基金项目： | 山东省农业良种工程项目“高档园林花卉新品种选育”（鲁科农字[2014]96 号）。 |
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| 摘 要： | 本研究旨在克隆玫瑰查尔酮合酶CHS基因并对其进行生物信息学分析,以期为利用基因工程技术改变玫瑰花色、培育玫瑰新品种奠定良好基础。以玫瑰品种‘唐红’(Rosa rugosa‘Tanghong’)为试材,采用RT-PCR和RACE方法从花瓣中获得了玫瑰查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因的c DNA全长。经生物信息学分析,该基因全长1416 bp,开放阅读框1167 bp,编码389个氨基酸,其蛋白的分子式为C1899H3043N505O562S18,相对分子质量为42.518 k Da,等电点为6.12。该蛋白不稳定系数低于40,为稳定性蛋白,无信号肽和剪切位点存在。其蛋白质二级结构主要由42.16%的α螺旋、29.05%的随机卷曲、10.54%的β转角和18.25%的延伸链组成。系统进化分析表明,玫瑰CHS基因与同科植物月季、草莓亲缘关系最近,与其他科及同科其他属植物的亲缘关系较远。本研究首次克隆了玫瑰CHS基因,获得了其生物信息学相关信息,探明了CHS基因在类黄酮生物合成过程中的重要作用,为改良玫瑰花色提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 玫瑰；查尔酮合酶基因；克隆；生物信息学 |
| 收稿时间： | 2015-01-31 |
| 修稿时间： | 2015-03-10 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of Chalcone Synthase Gene in Rosa rugosa |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Rosa rugosa Chalcone Synthase Gene Cloning Bioinformatics |
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