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| 小熊猫源犬瘟热病毒全基因序列的克隆及序列分析 | |
| 引用本文： | 王磊,王照,李天松,刘玉秀,冯娜,王胜乐,许薇薇,姜雪,高玉伟,王铁成,杨松涛,夏咸柱. 小熊猫源犬瘟热病毒全基因序列的克隆及序列分析[J]. 中国畜牧兽医, 2011, 38(11): 77-82 |
| 作者姓名： | 王磊 王照 李天松 刘玉秀 冯娜 王胜乐 许薇薇 姜雪 高玉伟 王铁成 杨松涛 夏咸柱 |
| 作者单位： | 1. 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所,吉林长春130062;吉林农业大学动物科技学院,吉林长春130062;吉林省人兽共患病预防与控制重点实验室,吉林长春130062 2. 吉林农业大学动物科技学院,吉林长春130062;吉林省地方病第一防治研究所,吉林白城137000 3. 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所,吉林长春130062;吉林农业大学动物科技学院,吉林长春130062 4. 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所,吉林长春,130062 5. 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所,吉林长春130062;吉林省人兽共患病预防与控制重点实验室,吉林长春130062 |
| 基金项目： | 国家林业局野生动物疫源疫病调查项目(2011001) |
| 摘 要： | 本研究对军事兽医研究所病毒二室分离驯化后的小熊猫源犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)基因组进行全序列测定,并对其基因组特征及H基因遗传稳定性进行比较分析。根据GenBank公布的犬瘟热病毒全长基因组序列设计合成17对特异性引物,以小熊猫源犬瘟热病毒总RNA为模板,RT-PCR进行分段扩增,并克隆到pEASY-Blunt Simple载体中,经测序、拼接获得全长cDNA序列。结果显示,小熊猫源犬瘟热病毒全基因序列与GenBank登录号分别为AF014953、AY445077、AY542312、AY466011、AY386316、AF164967、EU716337、EU726268、AY443350、AB474397、GU138403和AY649446的12个不同毒株全基因序列的同源性分别为86.6%、92.4%、92.5%、92.5%、94.3%、96.3%、95.9%、87.1%、94.5%、92.3%、87.4%和94.6%,与标准强毒株A75/17株(AF164967)的亲缘关系最近,全基因同源性达96.3%,但与疫苗株Onderstepoort(AF014953)亲缘关系相对较远,同源性为86.6%。小熊猫源犬瘟热病毒H基因与其他不同地区具有代表性的30株CDV进化树分析显示,小熊猫源犬瘟热病毒属于Asia Ⅰ型,H蛋白中309－311位氨基酸残基所形成的潜在糖基化位点,为疫苗株没有而野毒株所共有的,并且可能与病毒的免疫原性有关。因此,致弱的小熊猫源CDV在预防免疫的针对性上可能强于已有的疫苗株。 |
| 关 键 词： | 犬瘟热病毒 全基因测序 序列分析 |
Genomic Sequence Determination and Analysis of Lesser Panda Canine Distemper Virus |
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| WANG Lei,WANG Zhao,LI Tian-song,LIU Yu-xiu,FENG Na,WANG Sheng-le,XU Wei-wei,JIANG Xue,GAO Yu-wei,WANG Tie-cheng,YANG Song-tao,XIA Xian-zhu. Genomic Sequence Determination and Analysis of Lesser Panda Canine Distemper Virus[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2011, 38(11): 77-82 | |
| Authors: | WANG Lei WANG Zhao LI Tian-song LIU Yu-xiu FENG Na WANG Sheng-le XU Wei-wei JIANG Xue GAO Yu-wei WANG Tie-cheng YANG Song-tao XIA Xian-zhu |
| Affiliation: | 1. Institute of Military Veterinary,Academy of Military Medical Science of PLA,Changchun 130062,China;2. College of Animal Science and Technology,Jilin Agricultural University,Changchun 130062,China;3. Key Laboratory of Jilin Province for Zoonosis Prevention and Control, Changchun 130062,China;4. the First Institute for Control of Endemic Disease of Jilin Province,Baicheng 137000,China |
| Abstract: | The canine distemper virus(CDV) isoladed from lesser panda and domesticated by the laboratory of genome sequence determination,genetic characteristics and genetic stability of the H gene.According to full-length genome sequence of canine distemper virus published in GenBank,17 pairs of specific primers were designed and synthesized to amplify full-length cDNA as template with total RNA of lesser panda canine distemper virus,using the method of RT-PCR,and cloned into pEASY-Blunt Simple vector for determinati... |
| Keywords: | canine distemper virus genomic sequence determination sequence analysis |
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