| 盐胁迫下比拉底白刺差异表达基因的转录组分析 |
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| 引用本文： | 田林,尹丹丹,成铁龙,夏新莉,尹伟伦. 盐胁迫下比拉底白刺差异表达基因的转录组分析[J]. 林业科学研究, 2020, 33(1): 1-10 |
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| 作者姓名： | 田林 尹丹丹 成铁龙 夏新莉 尹伟伦 |
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| 作者单位： | 北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083;中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室,北京100091;南京林业大学生物与环境学院,江苏南京210037 |
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| 基金项目： | 唐古特白刺SOS信号通路在耐受高盐胁迫中的作用及其表观遗传分析 |
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| 摘 要： | [目的]为了挖掘比拉底白刺耐盐相关基因,对其盐胁迫下差异表达基因进行筛选分析。[方法]以比拉底白刺幼苗为材料,用200 mmol·L-1 NaCl对幼苗处理7 d,并对胁迫处理和对照植株叶片进行转录组测序及生物信息学分析。[结果]有效序列组装共得到应答盐胁迫的168 463条unigenes和196个差异表达基因。通过差异基因GO和KEGG功能聚类,分别获得64个GO功能小类和25条KEGG通路。进一步基因相互作用网络分析发现,转录调控、氧化还原以及抗逆相关基因在比拉底白刺应答盐胁迫中发挥重要作用,其中,筛选到3个重要的节点基因,分别是热激同源蛋白基因、L型凝集素类受体激酶基因和Win类蛋白基因。[结论]本研究获得了盐胁迫下比拉底白刺的差异表达基因及功能注释信息,有助于理解其耐盐的分子机制,为后续开发耐盐分子标记及通过基因编辑改良植物耐盐特性提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 比拉底白刺 盐胁迫 转录组 差异表达基因 功能分析 |
Transcriptome Analysis of Differentially Expressed Genes of Nitraria billardieri Under Salt Stress |
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| TIANLin,YINDan-dan,CHENG Tie-long,XIA Xin-li,YIN Wei-lun. Transcriptome Analysis of Differentially Expressed Genes of Nitraria billardieri Under Salt Stress[J]. Forest Research, 2020, 33(1): 1-10 |
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| Authors: | TIANLin YINDan-dan CHENG Tie-long XIA Xin-li YIN Wei-lun |
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| Affiliation: | (College of Biological Sciences and Technology,Beijing Forestry University,Beijing 100083,China;State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding,Chinese Academy of Forestry,Beijing 100091,China;College of Biology and the Environment,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037,Jiangsu,China) |
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