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水稻幼苗响应褐飞虱和稻瘿蚊的转录组分析
引用本文:卢柏亦,蒋哲,鄢柳慧,钟小惠,李晶莹,黄福钢,李发活,莫德原,邱永福. 水稻幼苗响应褐飞虱和稻瘿蚊的转录组分析[J]. 南方农业学报, 2022, 53(3): 628-640. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2022.03.005
作者姓名:卢柏亦  蒋哲  鄢柳慧  钟小惠  李晶莹  黄福钢  李发活  莫德原  邱永福
作者单位:广西大学农学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广西南宁 530004
摘    要:【目的】筛选出同时响应褐飞虱和稻瘿蚊取食的基因,揭示水稻幼苗应对2种害虫时基因表达层面的差异,为后续挖掘广谱抗虫基因和解析水稻抗虫机制打下理论基础。【方法】以水稻品种9311为供试植物,分别对15日龄的水稻幼苗进行褐飞虱和稻瘿蚊接虫处理,观测幼苗表型,并通过转录组测序技术分别对褐飞虱接入后24 h和稻瘿蚊接入后7 d的水稻幼苗进行转录组测序。以水稻日本晴基因组作为参考基因组进行对比,利用FPKM法计算基因表达量,设定参数(|log2 FC|>1且P<0.05)筛选差异表达基因。结合基因差异表达分析和功能富集分析,研究水稻响应2种害虫的机制异同点。【结果】鉴定出响应褐飞虱取食的差异表达基因3963个,响应稻瘿蚊取食的差异表达基因1206个,有251个差异表达基因同时响应2种害虫,其中108个具有相同表达模式,143个具有相反表达模式。GO功能注释分析表明,褐飞虱取食显著影响植物体内细胞壁合成和缺水响应,而稻瘿蚊取食则对植物光合作用的影响更显著,具有相同表达模式的差异表达基因主要富集在光合作用、水杨酸合成、茉莉酸信号转导和伤害响应等生物学功能,而具有相反表达模式的差异表达基因仅富集在乙醛酸循环。KEGG信号通路富集分析表明,褐飞虱和稻瘿蚊取食均显著影响植物体内次生代谢物的合成,相同表达模式的差异表达基因富集到MAPK信号通路、植物激素信号转导通路及光合作用等6个通路,而相反表达模式的差异表达基因没有富集的通路。【结论】水稻应对褐飞虱和稻瘿蚊的基因表达调控存在相同点和不同之处,共响应2种害虫的调控通路可能在水稻抗虫过程中发挥重要作用。

关 键 词:水稻   褐飞虱   稻瘿蚊   转录组
收稿时间:2022-01-16

Transcriptome analysis of rice seedlings responding to brown planthopper infestation and to gall midge infestation
LU Bai-yi,JIANG Zhe,YAN Liu-hui,ZHONG Xiao-hui,LI Jing-ying,HUANG Fu-gang,LI Fa-huo,MO De-yuan,QIU Yong-fu. Transcriptome analysis of rice seedlings responding to brown planthopper infestation and to gall midge infestation[J]. Journal of Southern Agriculture, 2022, 53(3): 628-640. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2022.03.005
Authors:LU Bai-yi  JIANG Zhe  YAN Liu-hui  ZHONG Xiao-hui  LI Jing-ying  HUANG Fu-gang  LI Fa-huo  MO De-yuan  QIU Yong-fu
Affiliation:College of Agriculture, Guangxi University/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Nanning, Guangxi 530004, China
Abstract:
Keywords:
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