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油葵SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选
引用本文:房冬梅,吕 品,侯建华. 油葵SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选[J]. 中国农学通报, 2015, 31(12): 205-209. DOI: 10.11924/j.issn.1000-6850.2014-2456
作者姓名:房冬梅  吕 品  侯建华
作者单位:(内蒙古农业大学农学院,呼和浩特 010019)
基金项目:基金项目:内蒙古自然科学基金重点项目“油用向日葵抗旱性相关性状的QTL分析研究”(2010zd06);国家自然科学基金项目“向日葵抗(耐)旱相关性状基因QTL定位及分析”(31160288)。
摘    要:为了获得适合油葵的SSR-PCR反应体系,通过采用控制变量法对影响SSR反应体系的主要因素进行优化,研究Mg2+浓度、dNTPs浓度、Taq酶浓度、引物浓度、退火温度等因素。结果表明各因素的终浓度分别在Mg2+浓度2.5 mmol/L、dNTPs浓度0.2 mmol/L、Taq酶量0.5 U、引物浓度0.4 μmol/L及退火温度为53.9℃时最为适合。通过试验优化后的体系筛选引物,最终从50对引物筛得19对多态性好的引物可进行下一步的研究。

关 键 词:芝麻  芝麻  施肥水平  品种  干物质积累与分配  
收稿时间:2014-09-10
修稿时间:2014-09-10

Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening in Oil Sunflower
Fang Dongmei,Lv Pin and Hou Jianhua. Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening in Oil Sunflower[J]. Chinese Agricultural Science Bulletin, 2015, 31(12): 205-209. DOI: 10.11924/j.issn.1000-6850.2014-2456
Authors:Fang Dongmei  Lv Pin  Hou Jianhua
Affiliation:(College of Agronomy, Inner Mongolia Agricultural University, Huhhot 010019)
Abstract:In order to obtain the SSR-PCR reaction system for oil sunflower, the method of control variable had been used to optimize the main factors influencing the SSR reaction system, which include the concentration of Mg2 , dNTPs, Taq enzyme, primer, and annealing temperature. Results showed that the optimized SSR reaction system was Mg2 2.5 mmol/L, dNTPs 0.2 mmol/L, Taq polymerase 0.5 U, primer 0.4 μmol/L and the annealing temperature 53.9℃. Through the testing system after optimization, 19 pairs of polymorphic good primer could be used for the next research from 50 pairs of primers screening.
Keywords:SSR   reaction system   primer screening
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