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基因宏阵列和荧光定量PCR方法对西瓜枯萎病害土壤中尖孢镰刀菌的快速检测和定量
引用本文:赵爽,罗佳,凌宁,徐大兵,朗娇娇,胡江,沈其荣. 基因宏阵列和荧光定量PCR方法对西瓜枯萎病害土壤中尖孢镰刀菌的快速检测和定量[J]. 土壤学报, 2010, 47(4): 703-708
作者姓名:赵爽  罗佳  凌宁  徐大兵  朗娇娇  胡江  沈其荣
作者单位:1. 南京农业大学资源与环境科学学院,南京,210095;江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室,江苏宜兴,214200
2. 江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室,江苏宜兴,214200
基金项目:国家自然科学基金项目(40871126)资助
摘    要:采用基因宏阵列(Macroarray)和荧光定量PCR(Real-time PCR)的方法,对引起西瓜枯萎病害的病原菌尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)进行了快速监测和快速绝对定量,并且对实验条件进行了优化和摸索。结果显示,在西瓜枯萎病害发病较为严重的处理N-+P-和N-+P+的根际土壤中,Macroarray检测到强烈的阳性信号,表明尖孢镰刀菌的大量存在,同时荧光定量PCR的结果也表明在这两个处理的根际土壤中尖孢镰刀菌数量最多,分别为每g土壤8.89×105和2.24×105个拷贝数;而在未发生枯萎病害的处理N++P-和N++P+中,Macroarray未检测到阳性信号,根际土壤中尖孢镰刀菌数量分别为每g土壤6.23×103和3.28×103个拷贝数;而四个处理的土体土壤中尖孢镰刀菌的数量均维持在每g土壤102~103个拷贝数,Macroarray未检测到阳性信号。与传统检测方法如病原菌的分离培养、平板稀释计数等相比,上述分子生物学方法对病原真菌的检测和定量更为准确快速、省时省力。

关 键 词:尖孢镰刀菌  基因宏阵列  实时荧光定量PCR  SYBR Green I
收稿时间:2009-06-23
修稿时间:2010-02-08

Quick check and quantification of fusarium oxysporum in soil with macroarray and real-time PCR method
zhaoshuang. Quick check and quantification of fusarium oxysporum in soil with macroarray and real-time PCR method[J]. Acta Pedologica Sinica, 2010, 47(4): 703-708
Authors:zhaoshuang
Affiliation:College of Resources and Environmental Sciences, Nanjing Agricultural University; Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization;Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization;Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization;Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization;Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization;College of Resources and Environmental Sciences, Nanjing Agricultural University; Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization;College of Resources and Environmental Sciences, Nanjing Agricultural University; Jiangsu Key Lab for Solid Organic Waste Utilization
Abstract:
Keywords:Fusarium oxysporum   Macroarray   Real-time PCR   SYBR Green I
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