| 郏县红牛和安格斯牛18月龄背最长肌差异表达基因的筛选与分析 |
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| 引用本文： | 张格阳,李玉龙,朱肖亭,张志杰,翟亚莹,牛欣然,黄永震,曾滔,张子敬,施巧婷,王二耀,吕世杰.郏县红牛和安格斯牛18月龄背最长肌差异表达基因的筛选与分析[J].畜牧与兽医,2023(5):14-20. |
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| 作者姓名： | 张格阳 李玉龙 朱肖亭 张志杰 翟亚莹 牛欣然 黄永震 曾滔 张子敬 施巧婷 王二耀 吕世杰 |
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| 作者单位： | 1. 河南省农业科学院畜牧兽医研究所/河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室;2. 河南农业大学动物科技学院;3. 西北农林科技大学动物科技学院;4. 新疆哈密市畜牧工作站 |
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| 基金项目： | 河南省科技攻关项目(222102110018)；;国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)； |
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| 摘 要： | 旨在通过转录组学分析筛选出影响牛肌肉发育的候选基因。对5头18月龄的郏县红牛背最长肌进行转录组测序，获得转录组数据后与3头18月龄安格斯牛背最长肌的转录组数据(GSE57327)进行联合分析。结果：与安格斯牛相比，郏县红牛背最长肌中4 945个基因表达显著上调(FDR<0.05), 2 186个基因显著下调(FDR<0.05)。GO功能富集分析显示差异基因主要富集在与代谢相关生物学过程中。KEGG信号通路分析显示差异表达的基因主要富集到氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)等通路上。从氧化磷酸化通路中筛选出两品种间差异表达最显著的20个基因，通过反刍动物基因组数据库(ruminant genome database, RGD)查看该20个基因的组织表达情况，其中泛素-细胞色素c还原酶复合物Ⅲ亚基Ⅺ(UQCR11)、细胞色素c氧化酶亚基7A1(COX7A1)、细胞色素c铜伴侣蛋白(COX17)、NADH氢酶辅酶Q铁硫蛋白5(NDUFS5)和线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP5F1E)这5个基因在牛骨骼肌组织中的表达量高于其他组织，推测这5个基因在牛的...
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| 关 键 词： | 郏县红牛 安格斯牛 转录组 肌肉 候选基因 |
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