合作猪γ-IFN基因外显子4多态性分析 |
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引用本文: | 马小军,李娟娟,王立贤,罗玉柱,魏恒,张小丽,李小飞.合作猪γ-IFN基因外显子4多态性分析[J].畜牧与兽医,2011,43(12). |
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作者姓名: | 马小军 李娟娟 王立贤 罗玉柱 魏恒 张小丽 李小飞 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070;甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃兰州730070 2. 渭南职业技术学院畜牧兽医系,陕西渭南,714000 3. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193 4. 甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃兰州,730070 5. 甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州,730070 |
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摘 要: | 为了研究合作猪γ-IFN基因的多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点,各等位基因是否符合Hardy-Weinberg平衡状态、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度,采用PCR-SSCP方法检测了138头合作猪γ-IFN基因外显子4的等位基因,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因序列,就基因型和等位基因单倍型序列数据开展分析。序列比对分析发现5个核苷酸多态位点,其中5 284 bp(A→G)、5 341 bp(G→A)、5 371 bp(A→G)为新发现突变位点。试验群体发现4种基因型AA、AB、AC和AD,其中A等位基因频率为0.963 8,为优势等位基因。经χ2适合性检验,该群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。γ-IFN基因遗传多态指数中,杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)均较低,表明合作猪γ-IFN基因比较保守。
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关 键 词: | 合作猪 γ-IFN基因 PCR-SSCP 多态性 |
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