华东地区猪圆环病毒2型基因型鉴别及ORF2遗传变异分析 |
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引用本文: | 王苗苗,王婷婷,朱建国.华东地区猪圆环病毒2型基因型鉴别及ORF2遗传变异分析[J].畜牧与兽医,2018(7). |
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作者姓名: | 王苗苗 王婷婷 朱建国 |
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作者单位: | 上海交通大学农业与生物学院/上海市兽医生物技术重点实验室 |
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摘 要: | 利用PCR方法对2014-2015年采集于华东地区部分猪场的病料进行猪圆环病毒2型(PCV2)检测,将所得阳性样品进行2a/2b鉴别分型。同时,选取15份阳性样品扩增ORF2完整序列,并利用DNAStar软件进行同源性分析和系统进化树分析。结果表明,335份病料中PCV2阳性样品146份,其中PCV2a型11份(7.53%)、PCV2b型127份(86.99%),共感染率5.48%,说明华东地区感染的PCV2以2b基因型为主,少数为2a基因型。同源性分析表明,试验所得15株ORF2序列同源性为89.9%~99.9%,与国内外参考毒株同源性为86.2%~99.7%,均存在较高的同源性。系统进化树表明,15株序列中有9株属于PCV2b型,4株属于PCV2d型,2株属于PCV2a型,未出现2c和2e基因型。本试验为进一步研究PCV2遗传变异趋况及新型疫苗的研制积累了有效材料。
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