绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析 |
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引用本文: | 宋旭婷,翟羽飞,张嘉楠,亓美玉,王志鹏,付晶,姚玉昌.绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析[J].中国畜牧杂志,2019(1):46-51. |
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作者姓名: | 宋旭婷 翟羽飞 张嘉楠 亓美玉 王志鹏 付晶 姚玉昌 |
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作者单位: | 1.黑龙江普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室;2.东北农业大学动物科学技术学院;3.黑龙江省农业科学院畜牧研究所 |
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基金项目: | 黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12511034) |
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摘 要: | 为明确绵羊IGF-Ⅰ基因变异剪接体的生物学特性及其在生长发育过程中的功能,本研究成功获得了IGF-Ⅰ基因Ⅱ类的2种变异剪接体(Ea和Eb型),利用生物信息学方法预测分析2种变异剪接体的结构特性,并探讨其在不同组织中的表达规律。结果表明:Ea和Eb型由同一基因通过选择性剪切形成,均是绵羊中新发现的类型,预测其分别编码138 aa和172 aa,2种变异剪接体的信号肽剪切位点、进化同源性、亚细胞定位、蛋白质空间结构预测结果类似,但二者包含不同的共价修饰位点。组织表达分析表明,2种变异剪接体在肝组织中表达量均最高,其次为脂肪、胃、睾丸、肌肉和皮肤组织,心、脾、肺、肾、肠、膀胱组织的表达水平较低;在胃中,羔羊期2种变异剪接体表达水平均极显著高于成羊期(P<0.01),在睾丸中,羔羊期IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型表达水平显著高于成羊期(P<0.05)。总体上来看,在各种组织中IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型的表达水平高于Eb型,为优势转录本类型。
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关 键 词: | 绵羊 IGF-I基因 变异剪接体 生物信息学分析 组织表达 |
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