| 基于MeDIP-seq研究蛋氨酸对巨噬细胞炎症中甲基化水平的影响 |
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| 引用本文： | 徐翌斌,罗成龙,瞿浩,计坚,舒鼎铭.基于MeDIP-seq研究蛋氨酸对巨噬细胞炎症中甲基化水平的影响[J].中国畜牧杂志,2021(1):127-132. |
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| 作者姓名： | 徐翌斌 罗成龙 瞿浩 计坚 舒鼎铭 |
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| 作者单位： | ;1.畜禽育种国家重点实验室广东省畜禽育种与营养研究重点实验室广东省农业科学院动物科学研究所 |
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| 基金项目： | 广州市科技计划项目(201806010101);科技创新战略专项资金(高水平农科院建设)(R2018PY-QY002);广东省科技计划(2017B020232003);广东省现代农业科技创新联盟(2019KJ106);现代农业产业技术研究体系专项资金(CARS-41)。 |
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| 摘 要： | 本课题组前期已研究表明蛋氨酸(Met)能缓解脂多糖(LPS)诱导的巨噬细胞的炎症反应,但其调控的分子机制尚不明确。本研究旨在从甲基化角度初步探讨DNA甲基化与Met抑制LPS诱导巨噬细胞炎症中分子机制的相关性。应用全基因组甲基化测序技术(MeDIP-seq)检测空白组、LPS组和LPS+Met组细胞的全基因DNA,每组3个重复。结果表明:LPS组甲基化峰(peak)的数量、总长度和覆盖率均高于空白组和LPS+Met组;与空白组相比,LPS组的高甲基化基因数在不同基因功能元件上均多于低甲基化基因数;与LPS组相比,Met+LPS组的低甲基化基因数在不同基因功能元件上均多于高甲基化基因数。运用GO富集和KEGG分析发现,LPS组与LPS+Met组差异甲基化基因主要富集在单一生物过程(Single-Organism Process)和细胞过程(CellularProcess),信号通路主要富集在Hippo信号通路。本研究为Met调控机体免疫和炎症反应提供一定的科学依据。
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| 关 键 词： | 蛋氨酸 DNA甲基化 MeDIP-seq 巨噬细胞 |
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