| 通过比较转录组分析鉴定山麻鸭开产调控基因 |
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| 引用本文： | 林冰锦,周晓莉,江丹莉,伍仲平,许丹宁,田允波,李秀金,黄运茂.通过比较转录组分析鉴定山麻鸭开产调控基因[J].中国畜牧杂志,2023(4):83-89+95. |
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| 作者姓名： | 林冰锦 周晓莉 江丹莉 伍仲平 许丹宁 田允波 李秀金 黄运茂 |
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| 作者单位： | 1. 仲恺农业工程学院动物科技学院;2. 广东省水禽健康养殖重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（32072730）；;国家重点研发计划重点专项（2016YFD0500510）； |
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| 摘 要： | 蛋鸭开产与卵巢发育有紧密联系，本实验旨在探索山麻鸭开产前后卵巢形态变化及基因表达的差异，鉴别参与启动开产的关键基因，为后期蛋鸭开产相关的分子遗传机制研究奠定基础。在山麻鸭开产前后的S1期（81日龄）和S2期（137日龄）分别选取3个个体的卵巢基质进行转录组测序，对转录组数据开展差异表达分析、功能富集分析及关键基因筛选，同时对关键基因进行荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。在差异倍数log2转换的绝对值（|log2(FoldChange)|）大于1.5、矫正P值<0.05的筛选条件下鉴别出382个差异表达基因。基于382个差异表达基因的GO功能注释发现与卵泡生长和卵巢功能调节相关的通路：细胞外基质的组织、细胞外基质结构成分和含有胶原蛋白的细胞外基质相关途径；KEGG富集分析发现上述基因显著富集于ECM受体相互作用和PI3K-Akt信号通路。在涉及上述重要富集通路的基因中有9个基因交集：CD44、COL1A1、COL6A1、CREB3L1、ITGB2、THBS2、VWF、VEGFC、WNT5B，通过qRT-PCR验证了这9个基因在转录组数据差异表达方面的可靠性。在这9个基因中，CO...
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| 关 键 词： | 山麻鸭 开产 差异表达基因 功能富集 |
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