| 象草PAL基因克隆及其蛋白质结构与功能预测 |
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| 引用本文： | 陈卫卫,唐然,吴昱煜,李菲,张向前,解新明.象草PAL基因克隆及其蛋白质结构与功能预测[J].草地学报,2016,24(1):137-145. |
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| 作者姓名： | 陈卫卫 唐然 吴昱煜 李菲 张向前 解新明 |
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| 作者单位： | 华南农业大学林学与风景园林学院,广东广州,510642;华南农业大学林学与风景园林学院,广东广州510642;广东省草业工程技术研究中心,广东广州510642 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31272491;30972138)，教育部高等学校博士学科点专项科研基金(20124404110011) |
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| 摘 要： | 苯丙氨酸解氨酶(PAL)是植物木质素生物合成途径中的关键酶,参与木质素、类黄酮和花青素等次生代谢产物的形成。本研究以‘N51’象草(Pennisetum purpureum)为材料,通过同源克隆、3′RACE和hi-Tail PCR的方法,对PAL基因进行克隆,得到PpPALcDNA序列2429bp以及DNA序列全长3907bp。PpPAL编码的蛋白包含720个氨基酸,具有典型的GTITASGDLVPLSYIAG苯丙氨酸解氨酶保守活性基序。运用生物信息学进行分析,PpPAL基因cDNA序列与玉米(Zea mays L.)ZmPAL的相似性最高为94%,与其他禾本科植物也有着较高的相似性。在氨基酸序列系统进化分析中,PpPAL与ZmPAL遗传距离最近,并与其他禾本科植物PAL聚为一类。PpPAL蛋白的三维结构模型显示,PpPAL蛋白具有典型的"海马状"结构,表明PpPAL是典型的苯丙氨酸解氨酶家族,对木质素的合成起着重要的作用。
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| 关 键 词： | 象草 木质素 苯丙氨酸解氨酶 生物信息学 |
Cloning of a PAL Gene of Pennisetum purpureum and Prediction of Its Protein Structure and Function |
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| CHEN Wei-wei,TANG Ran,WU Yu-yu,LI Fei,ZHANG Xiang-qian,XIE Xin-ming.Cloning of a PAL Gene of Pennisetum purpureum and Prediction of Its Protein Structure and Function[J].Acta Agrestia Sinica,2016,24(1):137-145. |
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| Authors: | CHEN Wei-wei TANG Ran WU Yu-yu LI Fei ZHANG Xiang-qian XIE Xin-ming |
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| Keywords: | Pennisetum purpureum Lignin Phenylalanine ammonia-lyase Bioinformatic analysis |
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