不同降温模式下高加索三叶草的转录组比较分析

为探讨高加索三叶草（Trifolium ambiguum Bieb.）对不同降温模式低温胁迫的响应机制，本试验以缓慢降温（Gradual cooling，GC）和骤然降温（Sudden cooling，SC）处理对其进行了胁迫处理。通过转录组测序，比较了2个低温处理组与常温对照组（CK）间的转录组差异，并筛选了抗寒相关的基因和转录因子。结果表明：与CK相比，GC组和SC组中分别有8 020个和6 289个差异表达基因（DEGs）；GC组的DEGs主要在光合作用、光合作用天线蛋白、淀粉和蔗糖代谢等通路显著富集，SC组的DEGs主要在淀粉和蔗糖代谢、倍半萜和三萜生物合成、类黄酮生物合成等通路显著富集。此外，2处理组共有的DEGs仅在淀粉和蔗糖代谢通路显著富集；一些涉及淀粉和蔗糖代谢与植物激素信号转导通路的基因在2种降温模式下均上调表达，可作为潜在的抗寒基因，如BAM3，BFRUCT1，SUS，GH3.1，SAPK2等。进一步分析发现响应低温胁迫的转录因子主要分布在AP2/ERF，ZFP，MYB等家族。