| 白羊草叶片和根系干旱胁迫下microRNAs差异表达分析 |
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| 引用本文： | 李春艳,董洁,钟华,董宽虎.白羊草叶片和根系干旱胁迫下microRNAs差异表达分析[J].草地学报,2019,27(3):539-546. |
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| 作者姓名： | 李春艳 董洁 钟华 董宽虎 |
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| 作者单位： | 山西农业大学动物科技学院,山西太谷030801;山西省农业科学院畜牧兽医研究所,山西太原 030032;北京市科学技术情报研究所,北京,100044;山西农业大学动物科技学院,山西太谷,030801 |
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| 基金项目： | 高等学校博士学科点专项科研基金;山西省科技攻关计划;山西省科技基础条件平台建设项目 |
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| 摘 要： | 为了探索干旱胁迫下白羊草miRNAs的组织特异性,本研究在干旱胁迫下白羊草(Bothriochloa ischaemum)转录组数据的基础上,采用Illumina测序技术和生物信息学方法,对干旱胁迫和正常生长条件下白羊草苗期叶片和根系miRNAs(microRNAs)进行鉴定和表达分析研究。结果从4个库中鉴定出白羊草中有属于20个家族的79个已知miRNAs和92个新miRNAs。干旱胁迫后叶片和根系中差异表达的miRNAs分别有65个(上调28和下调37)和27个(上调15和下调12)。响应干旱胁迫的主要miRNAs为miR156,miR164,miR166,miR169,miR172,miR396,miR398,miR408,miR528。对这些miRNAs预测的靶基因进行GO生物功能和KEGG代谢通路富集分析表明,植物激素信号转导是叶片和根系响应干旱胁迫共同富集的主要代谢通路,而黄酮类化合物生物合成则是干旱胁迫下叶片富集的最主要代谢通路。
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| 关 键 词： | 白羊草 干旱胁迫 MiRNA 生物信息学 |
MicroRNAs Expressions Profiling of Bothriochloa ischaemum Leaves andRoots under Drought Stress |
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| LI Chun-yan,DONG Jie,ZHONG Hua,DONG Kuan-hu.MicroRNAs Expressions Profiling of Bothriochloa ischaemum Leaves andRoots under Drought Stress[J].Acta Agrestia Sinica,2019,27(3):539-546. |
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| Authors: | LI Chun-yan DONG Jie ZHONG Hua DONG Kuan-hu |
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| Institution: | (College of Animal Science and Veterinary Medicine,Shanxi Agricultural University,Taigu,Shanxi Province 030801,China;Institute of Animal Husbandry and Veterinary,Shanxi Academy of Agricultural Sciences,Taiyuan,Shanxi Province 030032,China;Beijing Science and Technology Information Institute,Beijing 100044,China) |
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| Abstract: | LI Chun-yan;DONG Jie;ZHONG Hua;DONG Kuan-hu(College of Animal Science and Veterinary Medicine,Shanxi Agricultural University,Taigu,Shanxi Province 030801,China;Institute of Animal Husbandry and Veterinary,Shanxi Academy of Agricultural Sciences,Taiyuan,Shanxi Province 030032,China;Beijing Science and Technology Information Institute,Beijing 100044,China) |
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| Keywords: | Bothriochloa ischaemum Drought stress MiRNA Bioinformatics |
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