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草地早熟禾NADH-GOGAT基因的克隆及表达分析
引用本文:陈阳,孙华山,王玉书,张学通,师冉,熊良兵,金一锋.草地早熟禾NADH-GOGAT基因的克隆及表达分析[J].草地学报,2019,27(2):459-465.
作者姓名:陈阳  孙华山  王玉书  张学通  师冉  熊良兵  金一锋
作者单位:1. 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院, 抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室, 黑龙江 齐齐哈尔 161006;2. 东北农业大学园艺园林学院, 黑龙江 哈尔滨 150030
基金项目:国家自然科学基金;国家自然科学基金;黑龙江省自然科学基金;创新人才培养计划;基本科研业务费项目;黑龙江省大学生创新创业训练计划
摘    要:氮素是制约草坪草生长发育的重要因素之一,GS/GOGAT循环是植物氮同化的主要途径,谷氨酸合酶(glutamine:2-oxoglutarate amidotransferase,glutamate synthase,GOGAT)在植物氮素转化过程中发挥着重要的催化作用。本研究以草地早熟禾(Poa pratensis)为试材,基于二代测序RNA-seq相关数据,克隆得到草地早熟禾NADH-GOGAT基因,并进行生物信息学分析。结果表明:草地早熟禾NADH-GOGAT基因序列为3 236 bp,完整的开放阅读框(Open Reading Frame Finder,ORF)为1 338 bp,编码445个氨基酸残基组成的蛋白;预测NADH-GOGAT蛋白的分子量为49.89KD,等电点(isoelectric point,pI)为6.11,无信号肽,含有1个Glu_syn_central结构域,属于Glu_syn_central超级家族;二级结构以无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角为主;同源进化分析结果表明草地早熟禾NADH-GOGAT与硬粒黑小麦氨基酸序列相似度为97%。草地早熟禾NADH-GOGAT基因在叶部的相对表达量高于根与茎,低氮浓度更有利于该基因的表达。NADH-GOGAT在干旱胁迫和水氮互作中表达差异显著(P<0.05)。草地早熟禾NADH-GOGAT基因的克隆,及相关序列分析和基因表达,对进一步研究该基因的功能和草地早熟禾GS/GOGAT循环的调控过程具有一定意义。

关 键 词:草地早熟禾  谷氨酸合酶  基因克隆  氮素调控  
收稿时间:2018-12-03

Cloning and Expression Analysis of a NADH-GOGAT Gene in Kentucky Bluegrass
CHEN Yang,SUN Hua-shan,WANG Yu-shu,ZHANG Xue-tong,SHI Ran,XIONG Liang-bing,JIN Yi-feng.Cloning and Expression Analysis of a NADH-GOGAT Gene in Kentucky Bluegrass[J].Acta Agrestia Sinica,2019,27(2):459-465.
Authors:CHEN Yang  SUN Hua-shan  WANG Yu-shu  ZHANG Xue-tong  SHI Ran  XIONG Liang-bing  JIN Yi-feng
Institution:1. Key Laboratory of Resistance Gene Engineering and Preservation of Biodiversity in Cold Areas, College of Life Sciences, Agriculture and Forestry, Qiqihar University, Qiqihar, Heilongjiang Province 161006, China;2. College of Horticulture and Garden, Northeast Agricultural University, Harbin, Heilongjiang Province 150030, China
Abstract:CHEN Yang;SUN Hua-shan;WANG Yu-shu;ZHANG Xue-tong;SHI Ran;XIONG Liang-bing;JIN Yi-feng(Key Laboratory of Resistance Gene Engineering and Preservation of Biodiversity in Cold Areas,College of Life Sciences, Agriculture andForestry,Qiqihar University,Qiqihar,Heilongjiang Province 161006,China;College of Horticulture and Garden,Northeast AgriculturalUniversity,Harbin,Heilongjiang Province 150030,China)
Keywords:Kentucky bluegrass  GOGAT  Molecular cloning  Nitrogen management
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