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玉树牦牛与四个牦牛群体线粒体DNA D-Loop区遗传多样性分析
引用本文:侯孟典,宋仁德,王会,柴志欣,杨玉文,尕才仁,汪永洲,信金伟,钟金城.玉树牦牛与四个牦牛群体线粒体DNA D-Loop区遗传多样性分析[J].家畜生态学报,2020,41(3):21-26.
作者姓名:侯孟典  宋仁德  王会  柴志欣  杨玉文  尕才仁  汪永洲  信金伟  钟金城
作者单位:西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,四川成都610041;青海省玉树州畜牧兽医工作站,青海玉树815099;青海省玉树曲麻莱县畜牧兽医工作站,青海曲麻莱815500;青海省玉树杂多县畜牧兽医工作站,青海杂多815300;西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室,西藏拉萨850009
基金项目:国家肉牛牦牛产业技术体系项目
摘    要:利用线粒体DNA标记方法从分子水平上研究牦牛的遗传多样性。根据牦牛线粒体DNA(mtDNA)序列设计引物,扩增出长度为1 000 bp左右的片段,序列对比分析。结果表明:mtDNA D-Loop区长度为945 bp,共发现变异位点127个,单倍型71个,单倍型多样度(Hd)为0.909±0.016,核苷酸多样性(pi)为0.082;其中玉树牦牛发现变异位点74个,单倍型27个,单倍型多样度(Hd)为0.885±0.034,核苷酸多样性(pi)为0.0134;申扎牦牛单倍型多样度、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数均最高;5个牦牛群体D-Loop区序列具有一定的A/T碱基偏好性。玉树牦牛不遵循中性进化(P0.05),其余4个牦牛群体符合中性进化(P0.05);玉树牦牛与类乌齐牦牛和帕里牦牛的遗传距离较近(0.023、0.018),申扎牦牛与斯布牦牛的遗传距离最远(0.533)。发现玉树牦牛与其余4个群体的牦牛在同一个分支。斯布牦牛和申扎牦牛群体出现两个分支,说明玉树牦牛在进化的过程中可能不存在相互交流的情况。

关 键 词:玉树牦牛  分子标记  线粒体DNA  D-Loop区  遗传距离  系统发育树
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