| 西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性及系统进化分析 |
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| 引用本文： | 海汀,柴志欣,张成福,信金伟,姬秋梅,曾贤彬,钟金城.西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性及系统进化分析[J].家畜生态学报,2014,35(11):11-17. |
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| 作者姓名： | 海汀 柴志欣 张成福 信金伟 姬秋梅 曾贤彬 钟金城 |
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| 作者单位： | 1. 西南民族大学动物遗传育种学国家民委/教育部重点实验室,四川成都,610041
2. 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所,西藏拉萨,850000 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划，西南民族大学研究生创新型科研项目，西南民族大学研究生学位点建设项目 |
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| 摘 要： | 为从分子水平上探究西藏牦牛的序列多态性、遗传多态性及其系统进化关系,对西藏15个牦牛类群150个个体的mtDNA ND6基因全序列进行了测定,确定了多态位点和单倍型数目,计算了单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi),并构建了分子聚类关系图和单倍型系统发育树。结果表明:西藏牦牛mtDNA ND6基因全序列长度均为528bp,T、C、A和G 4种碱基的平均比例分别为42.2%、7.6%、20.9%、29.3%,存在一定的碱基组成偏倚性。序列变异中存在转换、颠换2种核苷酸变异类型,其中转换37次,颠换2次,表现出较强的转换偏倚性。根据序列间核苷酸变异共确定7种单倍型,其中Hap_1为西藏牦牛类群的主流单倍型,其余6种单倍型为部分类群所特有。平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.2978、0.00191,揭示西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性较贫乏。根据遗传距离构建了分子聚类关系图,表明西藏15个牦牛类群可分为2大类;根据7种单倍型序列构建了单倍型系统发育树,表明西藏牦牛存在2个母系起源。
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| 关 键 词： | 西藏牦牛 mtDNA ND6基因 遗传多样性 系统进化 |
Genetic Diversity and Phylogenetic Analysis on mtDNA ND6 of Tibetan Yaks |
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| HAI Ting,CHAI Zhi-xin,ZHANG Cheng-fu,XIN Jin-wei,JI Qiu-mei,ZENG Xian-bin,ZHONG Jing-cheng.Genetic Diversity and Phylogenetic Analysis on mtDNA ND6 of Tibetan Yaks[J].Acta Ecologae Animalis Domastici,2014,35(11):11-17. |
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| Authors: | HAI Ting CHAI Zhi-xin ZHANG Cheng-fu XIN Jin-wei JI Qiu-mei ZENG Xian-bin ZHONG Jing-cheng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Tibetan yak mtDNA ND6 genetic diversity phylogenetic |
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