西林水牛和富钟水牛mtDNA D-loop序列的遗传多样性研究 |
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作者单位: | 广西壮族自治区畜牧研究所,广西家畜遗传改良重点实验室,广西南宁,530001;西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌,712100;广西壮族自治区畜牧研究所,广西家畜遗传改良重点实验室,广西南宁,530001;西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌,712100 |
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基金项目: | 广西创新驱动发展专项;国家肉牛牦牛产业技术体系项目 |
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摘 要: | 该研究旨在探究西林水牛和富钟水牛mtDNA的遗传多样性和母系起源。采用PCR扩增、测序及生物信息学方法,测定了60头西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列。结合GenBank数据库已公布的25条西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列联合进行多态性分析,共检测到60个多态位点,定义了38种mtDNA单倍型。西林水牛和富钟水牛的单倍型多样度分别为0.909±0.028和0.913±0.035,核苷酸多样度分别为0.019±0.004和0.013±0.005,这一结果表明西林水牛和富钟水牛具有丰富的遗传多样性。NJ系统发育树显示,西林水牛和富钟水牛均属于沼泽型水牛,且有A支系和B支系两个母系起源。
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关 键 词: | 水牛 mtDNA D-loop 遗传多样性 母系起源 |
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