齐兴肉兔转录组测序及肌肉生长发育相关基因的筛选 |
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引用本文: | 邝良德,雷岷,李丛艳,任永军,郭志强,郑洁,张翔宇,张翠霞,杨超,唐丽,邓小东,谢晓红.齐兴肉兔转录组测序及肌肉生长发育相关基因的筛选[J].黑龙江畜牧兽医,2019(14). |
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作者姓名: | 邝良德 雷岷 李丛艳 任永军 郭志强 郑洁 张翔宇 张翠霞 杨超 唐丽 邓小东 谢晓红 |
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作者单位: | 四川省畜牧科学研究院动物遗传育种四川省重点实验室 |
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摘 要: | 为了研究不同发育阶段齐兴肉兔肌肉生长发育相关的差异表达基因,试验选取胚胎期18日龄、26日龄的齐兴肉兔骨骼肌进行转录组测序,与兔基因组数据库进行比对,筛选差异表达基因并进行GO分析,进一步筛选与肌肉生长发育相关的差异表达基因,并通过qRT-PCR对筛选基因进行验证。结果表明:胚胎期26日龄共获得5 320个差异表达基因,其中上调基因2 607个、下调基因2 713个;KEGG功能注释发现差异基因显著富集到癌症通路、细胞骨架调控通路、pi3k-akt信号通路和RAP1信号通路;筛选获得的6个基因与肌肉生长发育关系较为密切,其中上调基因分别为TPM1、CASQ1、MYOZ1、CKM、MYL3基因,下调基因为IGF2BP1基因。
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