猪传染性胃肠炎病毒S基因的克隆及其结构特征

参照GenBank中登录的TGEVS基因序列设计了3对特异引物，经RT-PCR扩增获得了TS株S基因的SⅠ、SⅡ和SⅢ3个片段，其大小分别约为1262、2368和1266bp。SⅠ、SⅡ和SⅢ片段经剪接后，可知TS株的S基因全长为4347nt，共编码1449个氨基酸。对TS株与其他毒株的S基因序列进行比较发现，TS株与Miller株、FS722／70株、TGEVH株、961933株、TFI株均在1124～1129位有5′-ATGATA-3′六个碱基，而在Purdue株、TH-98株、NEB72RT株和PRCV-HOL87株中缺失；TS株与Miller株、FS722／70株、TFI株、Purdue株、96-1933株、TGEVH株、TH-98株、NEB72-RT株和PRCV-HOL87株的核苷酸序列同源性分别为99．69／6、98．9％、98．0％、98．3％、95．7％、99．3％、97．7％、98．3％和97．5％。推导氨基酸序列的同源性分别为99．2％、98．4％、97．7％、97．8％、94．8％、98．6％、97．2％、97．7％和97．0％；TS株S蛋白的推导氨基酸序列较Purdue株、TH-98株和NEB72-RT株多出2个潜在的糖基化位点，共34个。与不同毒株比较后，推测在TGEV的S蛋白中第71位的Asp(D)与呼吸道嗜性有关，第219位的Ala(A)与肠道嗜性有关。