| 副猪嗜血杆菌OMP5 基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘建,汤德元,罗险峰,曾智勇,李春燕,甘振磊,王凤,郝飞,王洪光.副猪嗜血杆菌OMP5 基因的克隆及生物信息学分析[J].猪业科学,2013(11):92-94. |
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| 作者姓名： | 刘建 汤德元 罗险峰 曾智勇 李春燕 甘振磊 王凤 郝飞 王洪光 |
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| 作者单位： | 贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025;贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025;贵州省动物疫病预防控制中心, 贵州 贵阳 550008;贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025;贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025;贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025;贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025;贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025;贵州大学动物科学学院, 贵州 贵阳 550025 |
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| 基金项目： | 贵州省2011 年农业攻关项目资助[编号：黔科合NY字（2011）3103号]；贵州省2010 年农业科技攻关项目[编号：黔科合NY字（2010）3042号] |
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| 摘 要： | 根据GenBank 上公布的副猪嗜血杆菌外膜蛋白OMP5 基因的核苷酸序列，设计1 对特异性引物，对贵州省HPS 分离株OMP5 基因进行扩增。结果表明所扩增的OMP5 基因的长度为1116 bp，与SH0165 株对应的核苷酸序列和氨基酸同源性均为100%。生物信息学分析结果表明，OMP5 基因所编码的外膜蛋白P5 的理论等电点pI为9.34，不稳定系数为20.44，推测其为稳定性蛋白；脂肪指数为83.94，总体平均亲水性为-0.172，推测该蛋白是一种亲水性蛋白；该蛋白含有丰富的α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲，无跨膜区，最前端的21 个N-末端氨基酸残基为信号肽序列并且主要为疏水性氨基酸，最佳切割位点在第21～22 个氨基酸之间；结构位点预测表明该蛋白含有多个不同的糖基化和磷酸化位点。
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| 关 键 词： | 副猪嗜血杆菌 OMP5 基因 克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2013/3/21 0:00:00 |
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