| 鸡脂肪组织TCF21基因启动子区DNA甲基化与其表达的关系 |
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| 引用本文： | 刘雨萌,马艳艳,姜海煦,张心扬,武春艳,程博涵,李辉.鸡脂肪组织TCF21基因启动子区DNA甲基化与其表达的关系[J].畜牧兽医学报,2021,52(12):3375-3389. |
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| 作者姓名： | 刘雨萌 马艳艳 姜海煦 张心扬 武春艳 程博涵 李辉 |
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| 作者单位： | 1. 农业农村部鸡遗传育种重点实验室, 哈尔滨 150030;2. 黑龙江普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室, 哈尔滨 150030;3. 东北农业大学动物科学技术学院, 哈尔滨 150030 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31772586）；财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系（CARS-41） |
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| 摘 要： | 旨在研究鸡脂肪组织中TCF21基因启动子区DNA甲基化水平与其表达的关系。以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系（简称高、低脂系）第24世代7周龄肉鸡为试验材料，利用RT-qPCR检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因的mRNA表达水平；利用生物信息学和双荧光素酶报告系统分析TCF21基因启动子的结构与功能；利用Sequenom MassARRAY飞行质谱检测高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因启动子区CpG位点的甲基化水平；利用CpG甲基转移酶处理TCF21启动子报告基因质粒，分析DNA甲基化对TCF21基因启动子活性的影响。结果显示，高脂系肉鸡腹部脂肪组织中TCF21基因的mRNA表达水平极显著高于低脂系（P<0.001）；TCF21基因的启动子区存在40个CpG位点，且在启动子的近端和远端均有分布，但不存在CpG岛；将TCF21基因的启动子划分为5个功能区域，分别为R1区域（-2 000~-1 500 bp）、R2区域（-1 500~-1 000 bp）、R3区域（-1 000~-500 bp）、R4区域（-500~-200 bp）和Core区域（-200~-100 bp）；高脂系R2、R3和R2+R3区域的DNA甲基化水平显著或极显著高于低脂系（P<0.05或P<0.001）；R2、R3、R2+R3区域的DNA甲基化水平与TCF21基因mRNA表达水平呈显著正相关（R2区域：r=0.438，P<0.05；R3区域：r=0.371，P<0.05；R2+R3区域：r=0.489，P<0.05）；R2区域的DNA甲基化显著抑制其转录活性（P<0.05）。综上所述，TCF21基因在高、低脂系肉鸡腹部脂肪组织中的表达水平主要与其启动子R2区域的DNA甲基化水平有关。
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| 关 键 词： | 鸡 TCF21基因 启动子 DNA甲基化 基因表达 脂肪组织 |
| 收稿时间： | 2021-09-10 |
The Relationship between Promoter Region DNA Methylation of TCF21 Gene and Its Expression in Chicken Adipose Tissue |
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| LIU Yumeng,MA Yanyan,JIANG Haixu,ZHANG Xinyang,WU Chunyan,CHENG Bohan,LI Hui.The Relationship between Promoter Region DNA Methylation of TCF21 Gene and Its Expression in Chicken Adipose Tissue[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2021,52(12):3375-3389. |
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| Authors: | LIU Yumeng MA Yanyan JIANG Haixu ZHANG Xinyang WU Chunyan CHENG Bohan LI Hui |
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| Institution: | 1. Key Laboratory of Chicken Genetics and Breeding, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin 150030, China;2. Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Education Department of Heilongjiang Province, Harbin 150030, China;3. College of Animal Sciences and Technology, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | chicken TCF21 gene promoter DNA methylation gene expression adipose tissue |
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