基于转录组学研究双酚A对猪睾丸支持细胞炎症和氨基酸代谢通路的影响 |
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引用本文: | 胡婷,张永红,侯晓林,姚华,崔德凤,潘早早,张凌宇,张家希,吴琼.基于转录组学研究双酚A对猪睾丸支持细胞炎症和氨基酸代谢通路的影响[J].畜牧兽医学报,2023(7):2858-2871. |
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作者姓名: | 胡婷 张永红 侯晓林 姚华 崔德凤 潘早早 张凌宇 张家希 吴琼 |
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作者单位: | 北京农学院动物科学技术学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(32202881); |
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摘 要: | 旨在研究猪睾丸支持细胞(ST)暴露于环境雌激素双酚A(BPA)不同时间后的基因表达谱变化。本研究将猪ST细胞设为C、B两组,每组设置3个重复,C组为空白对照组,B组细胞暴露于50μmol·L-1浓度的BPA。BPA暴露6、24 h后,收集C6、B6、C24、B24组细胞总RNA样品,构建测序文库,通过双端150 bp测序方法进行高通量转录组测序。对组装数据进行功能注释、差异基因分析以及GO和KEGG富集分析。通过Real-time PCR方法对关键差异基因表达进行验证。BPA暴露24 h后差异基因数量(6 928个)较BPA暴露6 h差异基因数量(3 940个)明显增加。编码分泌型磷蛋白1的SPP1基因在BPA暴露6 h后表达增加,但在BPA暴露24 h后表达降低。管腔结合蛋白编码基因BIP、泛素B编码基因UBB、泛素C编码基因UBC、鸟氨酸脱羧酶1编码基因ODC1表达量在BPA暴露6和24 h后均显著上调。富集分析结果表明,BPA暴露6 h后,TNF信号通路富集差异倍数最高,...
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关 键 词: | 双酚A 猪睾丸支持细胞 转录组测序 富集分析 |
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