| 基于高密度SNP芯片技术对中国西门塔尔牛SCD1基因与肉质性状的相关性分析 |
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| 引用本文： | 张立敏,张猛,周正奎,刘利,刘喜冬,陈翠,陈晓杰,朱淼,袁峥嵘,李姣,许尚忠,高会江,高雪,张路培,李俊雅.基于高密度SNP芯片技术对中国西门塔尔牛SCD1基因与肉质性状的相关性分析[J].畜牧兽医学报,2012(6):878-886. |
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| 作者姓名： | 张立敏 张猛 周正奎 刘利 刘喜冬 陈翠 陈晓杰 朱淼 袁峥嵘 李姣 许尚忠 高会江 高雪 张路培 李俊雅 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室;东北农业大学动物科技学院 |
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| 基金项目： | 农业部专项(Nycytx-38);国家自然基金(30871774);转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08007-005B);“十一五”转基因重大专项(2008ZX08007-2);优质肉牛新品种(系)选育与关键技术研究及示范(2011BAD28B04);基于高密度SNP建立中国肉牛群体全基因组选择优化方案(2010jc-2) |
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| 摘 要： | 试验借助高密度SNP芯片技术在整个基因组范围内对223头中国西门塔尔牛群体进行基因分型,在SCD1基因上发现7个SNPs位点,对各SNP位点与西门塔尔牛肉质性状进行相关性分析。结果表明,SCD1基因的7个SNPs位点均与大理石花纹等级显著相关(P<0.05或P<0.01);A10050C、A13655G、C14790T和A15565G4个位点对剪切力影响显著(P<0.05);位点A13655G对肌内脂肪含量影响显著(P<0.05);位点A10050C、C14790T、A15565G不同基因型个体间脂肪颜色差异显著(P<0.05)。单体型分析结果显示,7个SNPs位点共构成6种单体型和14种单体型组合。单体型组合H3H6与高肌内脂肪含量极显著相关(P<0.01);单体型组合H6H6与优质大理石花纹极显著相关(P<0.01);单体型组合H4H6与高剪切力值显著相关(P<0.05);各单体型组合对肉色和脂肪颜色影响不显著。
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| 关 键 词： | 高密度SNP芯片 中国西门塔尔牛 SCD1基因 肉质性状 单体型 |
Association of SCD1 Gene with Meat Quality Traits in Chinese Simmental Based on High-density SNP Chip |
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| ZHANG Li-min,ZHANG Meng,ZHOU Zheng-kui,LIU Li,LIU Xi-dong,CHEN Cui,CHEN Xiao-jie,ZHU Miao,YUAN Zheng-rong,LI Jiao,XU Shang-zhong,GAO Hui-jiang,GAO Xue,ZHANG Lu-pei,LI Jun-ya.Association of SCD1 Gene with Meat Quality Traits in Chinese Simmental Based on High-density SNP Chip[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2012(6):878-886. |
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| Authors: | ZHANG Li-min ZHANG Meng ZHOU Zheng-kui LIU Li LIU Xi-dong CHEN Cui CHEN Xiao-jie ZHU Miao YUAN Zheng-rong LI Jiao XU Shang-zhong GAO Hui-jiang GAO Xue ZHANG Lu-pei LI Jun-ya |
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| Institution: | 1*(1.Key Laboratory of Farm Animal Genetic Resources and Utilization of Ministry of Agriculture,Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193,China;2.College of Animal Science and Technology,Northeast Agricultural University, Harbin 150030,China) |
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| Abstract: | |
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