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小鼠卵巢组织定量PCR分析中内参基因的筛选
引用本文:杨显英,熊显荣,韩杰,黄向月,王艳,阿果约达,李键.小鼠卵巢组织定量PCR分析中内参基因的筛选[J].畜牧兽医学报,2019(2):446-453.
作者姓名:杨显英  熊显荣  韩杰  黄向月  王艳  阿果约达  李键
作者单位:西南民族大学生命科学与技术学院;青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室
基金项目:四川省科技支撑计划(2017NZ0076);牦牛遗传资源与保护创新团队(13CXTD01)
摘    要:旨在选择小鼠卵巢组织中合适的内参基因,为研究卵巢发育过程中基因表达提供可靠数据。以不同年龄(0日龄、3周龄、5周龄、8周龄)小鼠卵巢组织为试验材料,Trizol法提取样本总RNA,并合成cDNA,根据已报道的小鼠(Mus musculus)各组织中相对稳定表达的8个常见内参基因(Gapdh、β-actin、β-tubulin、18S rRNA、16S rRNA、H2afz、Ubc、Rpl13a)的GenBank登录序列设计引物,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法构建卵巢cDNA等梯度(1∶10)稀释后的标准曲线;利用geNorm分析候选内参基因的表达稳定性(M);NormFinder筛选表达最稳定的内参基因;BestKeeper计算qRT-PCR结果的标准差(SD)和变异系数(CV),从而预测候选内参基因的稳定性。结果表明,8个内参基因的引物特异性较强,具有良好的线性关系;候选内参基因的表达稳定度排序:Gapdh=β-actin>18S rRNA>Ubc>16S rRNA> H2afz>Rpl13a>β-tubulin;其中Gapdh表达稳定性最好,且标准差及方差系数最小(SD:0.32,CV:1.95),H2afz标准差及方差系数最大(SD>1.0,CV:5.76)。综上表明,本研究成功获得出生后小鼠卵巢发育过程中稳定表达的内参基因(Gapdh和β-actin),可作为其基因表达研究中的最佳候选内参。

关 键 词:小鼠  卵巢  QRT-PCR  内参基因  表达稳定性

Identification of Suitable Reference Gene for Quantitative RT-PCR Analysis in Mouse Ovaries
YANG Xianying,XIONG Xianrong,HAN Jie,HUANG Xiangyue,WANG Yan,A GUO Yueda,LI Jian.Identification of Suitable Reference Gene for Quantitative RT-PCR Analysis in Mouse Ovaries[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2019(2):446-453.
Authors:YANG Xianying  XIONG Xianrong  HAN Jie  HUANG Xiangyue  WANG Yan  A GUO Yueda  LI Jian
Institution:(College of Life Science and Technology,Southwest Minzu University,Chengdu 610041,China;Key Laboratory of the Ministry of Education for Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation and Exploitation,Chengdu 610041,China)
Abstract:YANG Xianying;XIONG Xianrong;HAN Jie;HUANG Xiangyue;WANG Yan;A GUO Yueda;LI Jian(College of Life Science and Technology,Southwest Minzu University,Chengdu 610041,China;Key Laboratory of the Ministry of Education for Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation and Exploitation,Chengdu 610041,China)
Keywords:mouse  ovary  qRT-PCR  reference gene  expression stability
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