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鸡Lpin1基因c.1727C>T位点遗传变异及其与脂肪沉积性状的关联分析
引用本文:王伯君,孙玲,黎绍波,朱志明,刘榜.鸡Lpin1基因c.1727C>T位点遗传变异及其与脂肪沉积性状的关联分析[J].畜牧兽医学报,2010,41(9).
作者姓名:王伯君  孙玲  黎绍波  朱志明  刘榜
作者单位:1. 华中农业大学,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,农业部猪遗传育种重点开发实验室,武汉430070
2. 华中农业大学,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,农业部猪遗传育种重点开发实验室,武汉430070;福建农科院畜牧兽医研究所,福州350013
基金项目:华中农业大学大学生科技创新基金,国家高技术研究发展计划(863计划) 
摘    要:利用生物信息学分析方法对鸡Lpin1基因编码区进行扫描,选取该基因3个引起错义突变的变异位点进行分析,其中c.391GA位点引起编码氨基酸Asp131→Asn131突变,c.1727CT位点引起编码氨基酸Ala576→Val576突变,c.2287AC位点引起编码氨基酸Met763→Leu763突变。应用引入限制性酶切位点PCR(Amplifi-cation-Created Restriction Site PCR,ACRS-PCR)的方法进行引物设计扩增3个突变位点,并通过限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)检测PCR产物,以藏鸡、隐性白羽鸡、藏隐(藏鸡♂×隐性白羽♀)和藏藏隐藏鸡♂×(藏鸡♂×隐性白羽♀)♀]群体为材料对3个变异位点进行基因型检测,并与胴体性状进行关联分析;同时在5个中国地方鸡种(固始鸡、萧山鸡、北京油鸡、泰和丝羽乌骨鸡和茶花鸡)中进行变异位点的遗传多样性分析。结果表明:(1)鸡Lpin1基因c.1727CT在不同品种中具丰富的多态性;而另2个位点在所检测的群体中无多态性存在,c.391GA位点以GG基因型为主,c.2287AC位点全部为AA基因型;(2)对c.1727CT位点的遗传多样性分析表明该位点C等位基因占优势地位,且固始鸡和北京油鸡群体基因型分布显著偏离哈代-温伯格平衡定律(P0.01),在萧山鸡、泰和丝羽乌骨鸡和茶花鸡三品种中基因型分布均符合哈代-温伯格平衡定律。(3)性状关联分析显示c.1727CT位点与皮下脂肪厚呈显著关联(P0.05),与腹脂质量呈极显著关联(P0.01);其中CC基因型个体的皮下脂肪厚显著高于TT基因型个体(P0.05),极显著高于TC基因型个体(P0.01)。TT基因型个体的腹脂质量显著高于其他两种基因型个体(P0.05)。

关 键 词:  腹脂质量  皮下脂肪厚  关联分析

Genetic Variation of the Lpin1 c.1727C>T and Its Association with Fattiness Traits in Chicken
WANG Bo-jun,SUN Ling,LI Shao-bo,ZHU Zhi-ming,LIU Bang.Genetic Variation of the Lpin1 c.1727C>T and Its Association with Fattiness Traits in Chicken[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2010,41(9).
Authors:WANG Bo-jun  SUN Ling  LI Shao-bo  ZHU Zhi-ming  LIU Bang
Abstract:
Keywords:Lpin1
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