不同物种Oct-1基因编码区生物信息学分析 |
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引用本文: | 张天,李祥龙,周荣艳,李兰会,任玉红,赵驻军.不同物种Oct-1基因编码区生物信息学分析[J].中国草食动物,2012(Z1). |
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作者姓名: | 张天 李祥龙 周荣艳 李兰会 任玉红 赵驻军 |
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作者单位: | 河北农业大学动物科技学院,保定,071001 |
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摘 要: | 该研究采用生物信息学的方法分析了褐家鼠、小家鼠、野猪、猿、猕猴、狨、人、毛猩猩、黑猩猩、犬、牛、家马、大熊猫13个物种Oct-1基因编码区(CDS),并对该基因的遗传多样性、氨基酸序列、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构进行了分析和预测.结果表明,在13个物种45条基因序列中共检测到481个多态位点,生成20种单倍型,Oct-1基因序列编码区种内、种间存在丰富的遗传多样性.Oct-1蛋白不具有导肽,N端无信号肽,没有跨膜结构域,表现为亲水性,蛋白质二级结构主要结构元件是无规卷曲和α-螺旋.
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关 键 词: | Oct-1基因 生物信息学分析 遗传多样性 |
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