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不同物种Oct-1基因编码区生物信息学分析
引用本文:张天,李祥龙,周荣艳,李兰会,任玉红,赵驻军.不同物种Oct-1基因编码区生物信息学分析[J].中国草食动物,2012(Z1).
作者姓名:张天  李祥龙  周荣艳  李兰会  任玉红  赵驻军
作者单位:河北农业大学动物科技学院,保定,071001
摘    要:该研究采用生物信息学的方法分析了褐家鼠、小家鼠、野猪、猿、猕猴、狨、人、毛猩猩、黑猩猩、犬、牛、家马、大熊猫13个物种Oct-1基因编码区(CDS),并对该基因的遗传多样性、氨基酸序列、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构进行了分析和预测.结果表明,在13个物种45条基因序列中共检测到481个多态位点,生成20种单倍型,Oct-1基因序列编码区种内、种间存在丰富的遗传多样性.Oct-1蛋白不具有导肽,N端无信号肽,没有跨膜结构域,表现为亲水性,蛋白质二级结构主要结构元件是无规卷曲和α-螺旋.

关 键 词:Oct-1基因  生物信息学分析  遗传多样性
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