| 猪繁殖与呼吸综合征病毒GX1003株全基因序列测定与分析 |
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| 引用本文： | 施开创,林昌华,张步娴,官家明,李军,钟诚.猪繁殖与呼吸综合征病毒GX1003株全基因序列测定与分析[J].动物医学进展,2013,34(2):30-36. |
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| 作者姓名： | 施开创 林昌华 张步娴 官家明 李军 钟诚 |
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| 作者单位： | 1. 广西动物疫病预防控制中心,广西南宁,530001
2. 广西大学动物科学技术学院,广西南宁,530005 |
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| 摘 要： | 为了解广西省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异情况,采用RT-PCR对PRRSV广西地方分离株GX1003株全基因组进行分段扩增、测序与分析。结果表明,不包括Poly(A)尾,GX1003株基因组全长为15 320nt。同源性分析表明,GX1003株与比对的国内外PRRSV美洲型毒株全基因核苷酸及其推导氨基酸序列的同源性分别为85.0%～99.4%和82.1%～99.1%,与欧洲型代表株LV株的同源性分别为60.6%和51.3%。序列分析表明,GX1003株的NSP2编码区存在第481位aa和第533～561aa发生30个氨基酸的不连续缺失,具有高致病性PRRSV(HP-PRRSV)的遗传特征;同时,在不同编码区出现与HP-PRRSV代表株JXA1株不同的遗传变异现象。遗传进化分析表明,比对的所有美洲型毒株可以分为4个亚群,GX1003株分布在以JXA1株为代表的亚群4中。表明PRRSV广西地方分离株GX1003株属于HP-PRRSV,但其基因组在不同区域发生了新的遗传变异。
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| 关 键 词： | 猪繁殖与呼吸综合征病毒 高致病性 基因组序列 变异分析 |
Genomic Sequence Analysis of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus GX1003 Strain |
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| SHI Kai-chuang
,
LIN Chang-hua
,
ZHANG Bu-xian
,
GUAN Jia-ming
,
LI Jun
,
ZHONG Cheng.Genomic Sequence Analysis of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus GX1003 Strain[J].Progress In Veterinary Medicine,2013,34(2):30-36. |
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| Authors: | SHI Kai-chuang LIN Chang-hua ZHANG Bu-xian GUAN Jia-ming LI Jun ZHONG Cheng |
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| Institution: | 1.Guangxi Center for Animal Disease Control and Prevention,Nanning,Guangxi,530001,China; 2.College of Animal Science and Technology,Guangxi University,Nanning,Guangxi,530005,China) |
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| Abstract: | |
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