从罗氏沼虾肝胰腺转录组角度阐述罗氏沼虾对动植物蛋白利用的差异

为了探究罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii）对动植物蛋白利用的差异，从肝胰腺转录组角度出发，采用IlluminaHiSeqTM4000高通量测序平台对罗氏沼虾肝胰腺组织进行转录组测序。然后将所测序列经质控，组装后对比到GOKEGG等数据库中进行注释（梁华芳等，2013），并对其进行差异基因等的聚类分析。试验将健康的初始均重为0.448g的罗氏沼虾分为两组，分别以鱼粉为动物蛋白源（FP组），豆粕、玉米蛋白粉和谷朊粉为植物蛋白源（PP组）进行饲喂，每组3个重复，养殖周期为8周。结果显示，两组样本6个样品共产生160783350个Cleanreads，分别对两组样本6个样品进行两两比较，一共检测到518个差异表达基因，其中显著上调基因有460个，显著下调基因有58个，GO功能分析表明，差异表达的基因对比到GO数据库共37098个GOterm，这些term分别对应细胞组分，分子功能以及生物过程等三大类59个分支，差异基因主要涉及到糖类转运、氨基酸合成、酶活性细胞膜组成等。通过KEGG富集分析结果表明，两组样本之间的差异表达基因主要富集在139条通路上，主要涉及代谢、遗...