| 乙型脑炎病毒减毒SA14-14-2-B3株基因组全序列分析 |
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| 引用本文： | 张学涛,赵明秋,琚春梅,赵启祖,康艳梅,沈海燕,陈金顶.乙型脑炎病毒减毒SA14-14-2-B3株基因组全序列分析[J].中国预防兽医学报,2010,32(8). |
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| 作者姓名： | 张学涛 赵明秋 琚春梅 赵启祖 康艳梅 沈海燕 陈金顶 |
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| 作者单位： | 1. 华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642
2. 中国兽医药品监察所,北京,100081 |
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| 基金项目： | 农业公益性行业科研专项，广东省自然科学基金创新团队项目，教育部"长江学者和创新团队发展计划"创新团队项目，广东省科技计划项目 |
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| 摘 要： | 为进一步了解乙型脑炎病毒(JEV)减毒疫苗株基因组变异和分子遗传特性,本研究根据已发表的JEV基因组序列,设计合成了8对引物,应用RT-PCR对SA14-14-2-B3株基因组进行了克隆和序列测定,获得了该株病毒的全基因组序列(10977nt)并推导出其编码的氨基酸序列(3432aa)。序列分析表明:SA14-14-2-B3株与疫苗株SA14-14-2和SA(A)及野毒株SA14的核苷酸和氨基酸相似性较高,分别为99.8%、99.9%、99.4%和99.7%、99.8%、99.1%,与猪源分离株HEN0701和KV1899的核苷酸与氨基酸相似性较低,分别为88.5%、88.5%和97.6%、96.6%,比较显示在SA14-14-2-B3株基因组第10700nt处有一碱基"G"的插入。以全基因组为基础,对SA14-14-2-B3株进行遗传进化关系分析,结果表明:SA14-14-2-B3株与SA14源病毒株SA14、SA14-14-2、SA(A)、SA(V)及分离株Beijing-1、p3、WHe和HW的遗传关系较近,与XJP613株和HEN0701株的遗传关系较远。以E基因为基础,对SA14-14-2-B3株进行遗传进化关系分析,结果表明SA14-14-2-B3株属于JEV基因Ⅲ型。
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| 关 键 词： | 乙型脑炎病毒 SA14-14-2-B3株 基因组 序列分析 |
Complete genome sequence analysis of of Japanese encephalitis virus attenuated SA14-14-2-B3 vaccine strain |
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| ZHANG Xue-tao,ZHAO Ming-qiu,JU Chun-mei,ZHAO Qi-zu,KANG Yan-mei,SHEN Hai-yan,CHEN Jin-ding.Complete genome sequence analysis of of Japanese encephalitis virus attenuated SA14-14-2-B3 vaccine strain[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2010,32(8). |
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| Authors: | ZHANG Xue-tao ZHAO Ming-qiu JU Chun-mei ZHAO Qi-zu KANG Yan-mei SHEN Hai-yan CHEN Jin-ding |
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