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| 新型鸭肝炎病毒全基因组序列分析 | |
| 引用本文： | 袁率珍,范书才,李虹,李明义,范根成,姜畔,张兵,范小舟.新型鸭肝炎病毒全基因组序列分析[J].中国预防兽医学报,2010,32(7). |
| 作者姓名： | 袁率珍 范书才 李虹 李明义 范根成 姜畔 张兵 范小舟 |
| 作者单位： | 1. 中国兽医药品监察所,北京,100081 2. 青岛易邦生物技术有限公司,山东青岛,266032 3. 四川大学华西公共卫生学院,四川成都,610041 |
| 基金项目： | 国家科技基础条件平台建设项目 |
| 摘 要： | 为了解新型鸭肝炎病毒(DHV)基因组变异情况,本研究将广东地区分离到的1株,山东地区分离到的2株与1型DHV(DHV-1)无抗原交叉性的新型DHV(N-DHV)全基因组序列测定的结果进行了分析。结果表明,N-DHV基因组全长7786nt～7788nt,仅有一个ORF,其结构具有典型的微RNA病毒科病毒基因组特征。ORF编码一个2251aa的聚合蛋白,该蛋白经3Cpro切割产生3个结构蛋白(VP0、VP3、VP1)和8个非结构蛋白(2A1、2A2、2B、2C、3A、3B、3C、3D)。与其他N-DHV毒株及DHV-1的抗原性相关VP1蛋白氨基酸序列比对表明,3株病毒之间及与国内分离的N-DHVG株的同源性均在98%以上,与韩国N-DHV同源性均大于92%,与中国台湾地区N-DHV同源性为80.1%～80.9%,与DHV-1的同源性为76.9%～77.3%。3株病毒与韩国N-DHVVP1氨基酸差异位点主要集中在C-端的高变异区。依据微RNA病毒科人肠病毒属血清型分型标准,GD株、SD01株、SD02株与韩国N-DHV和G株属于同一血清型,而与DHV-1和中国台湾地区新型DHV属于不同的血清型。 |
| 关 键 词： | 鸭肝炎病毒 新血清型 序列分析 |
Genomic analysis of new serotype strains of duck hepatitis virus isolated in China |
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| YUAN Shuai-zhen,FAN Shu-cai,LI Hong,LI Ming-yi,FAN Gen-cheng,JIANG Pan,ZHANG Bing,FAN Xiao-zhou.Genomic analysis of new serotype strains of duck hepatitis virus isolated in China[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2010,32(7). | |
| Authors: | YUAN Shuai-zhen FAN Shu-cai LI Hong LI Ming-yi FAN Gen-cheng JIANG Pan ZHANG Bing FAN Xiao-zhou |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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