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我国部分地区鸡贫血病病毒全基因组核苷酸序列的比较与分析
引用本文:梁智选,杨汉春. 我国部分地区鸡贫血病病毒全基因组核苷酸序列的比较与分析[J]. 中国预防兽医学报, 2008, 30(2): 127-131
作者姓名:梁智选  杨汉春
作者单位:1. 中国农业大学,动物医学学院,北京,100094;天津市禽病诊断培训中心,天津,300402
2. 中国农业大学,动物医学学院,北京,100094
摘    要:本研究测定了3个鸡贫血病病毒(Chinken anemia virus,CAV)国内分离株及12个直接来源于临床样品的CAV毒株全基因组序列,结果表明15个CAV毒株的全基因组长度和结构与已报道的其它CAV毒株一致,长度均为2298nt,包含有3个重叠的ORFs。与GenBank发表的13个毒株序列进行序列比较发现,所有毒株核苷酸序列的相似性在95.2%~99.5%之间,CAV全基因组序列有2个高度变异区(HVR),分别位于1033nt~1470nt和1858nt~2193nt。CAVORF3变异度最高,其5’端2/5处和3’端2/5~1/5处为2个高度变异区。ORF2变异度也较高,主要出现在5’端1/4处,ORFI最为保守。以CAV全基因组核苷酸序列和ORF3核苷酸序列为基础分别构建的CAV毒株分子进化树,均可以将全部CAV毒株划分为2个基因群。我国部分地区分离的大多数毒株,属基因Ⅰ群,与德国Cux-1等主要流行毒株有较为相近的亲缘关系;其它CAV国内毒株,属基因Ⅱ群,与日本G6株和TR20株有着更为相近的关系。

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文章编号:1008-0589(2008)02-0127-05
收稿时间:2007-05-08
修稿时间:2007-05-08

Comparison and analysis of the complete genomic nucleotide sequences of chicken anemia virus isolates from some regions of China
LIANG Zhi-xuan,YANG Han-chun. Comparison and analysis of the complete genomic nucleotide sequences of chicken anemia virus isolates from some regions of China[J]. Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine, 2008, 30(2): 127-131
Authors:LIANG Zhi-xuan  YANG Han-chun
Abstract:
Keywords:
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