| 猪圆环病毒II型结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测 |
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| 引用本文： | 刘光清,倪征,云涛,梁华丽,华炯刚,李双茂,杜清云.猪圆环病毒II型结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测[J].中国预防兽医学报,2005(6). |
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| 作者姓名： | 刘光清 倪征 云涛 梁华丽 华炯刚 李双茂 杜清云 |
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| 作者单位： | 浙江省农业科学院农业部病毒学与生物技术重点开放实验室 浙江杭州310021
(刘光清，倪征，云涛，梁华丽，华炯刚，李双茂)，浙江省农业科学院农业部病毒学与生物技术重点开放实验室 浙江杭州310021(杜清云) |
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| 摘 要： | 本研究以猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)II型的基因组序列为材料,采用Garnier-Robson方法、Chou-Farplus方法和Karplus-Schulz方法预测了其结构蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用Emini方法预测了结构蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf方法预测了蛋白的抗原指数。然后综合评价了PCV-2型结构蛋白的B细胞抗原表位。结果表明,PCV-2结构蛋白形成α螺旋结构的能力较差,但是该蛋白含有较多的β折叠和转角结构,因而该蛋白具有丰富的二级结构。分析结果还表明结构蛋白具有多处抗原指数较高的区段,其中羧基端含有潜在的B细胞优势抗原表位,因此其在免疫学中的地位也应当引起重视。本研究将为猪圆环病毒的反向疫苗学的研究提供一定的理论依据。
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| 关 键 词： | 口蹄疫病毒 结构蛋白 B细胞表位 二级结构 |
Prediction of the secondary structure and B cell epitope for the cap protein of PCV-II |
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| LIU Guang-qing,NI Zheng,YUN Tao,LIANG Hua-li,HUA Jiong-gang,LI Shuang-mao DU Qing-yun.Prediction of the secondary structure and B cell epitope for the cap protein of PCV-II[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2005(6). |
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| Authors: | LIU Guang-qing NI Zheng YUN Tao LIANG Hua-li HUA Jiong-gang LI Shuang-mao DU Qing-yun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PCV-II cap protein B cell epitopes secondary structure |
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