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H1和H3亚型猪流感病毒二重TaqMan-MGB探针荧光RT-PCR检测方法的建立
引用本文:王建华,陈小金,张俊哲,王玉玲,肖妍,赵丹,谭旭菲,王乃福,陈本龙,董志珍,赵祥平.H1和H3亚型猪流感病毒二重TaqMan-MGB探针荧光RT-PCR检测方法的建立[J].中国动物检疫,2016,33(10):90-94.
作者姓名:王建华  陈小金  张俊哲  王玉玲  肖妍  赵丹  谭旭菲  王乃福  陈本龙  董志珍  赵祥平
基金项目:天津市科技支撑项目(13ZCZDNCO1300);天津市滨海新区惠民项目(2013-BK15H013)
摘    要:根据H1和H3亚型猪流感病毒(SIV)血凝素(HA)编码基因的保守序列,分别设计合成特异性引物和Taq Man-MGB探针,建立了一种检测H1和H3亚型SIV的二重荧光RT-PCR方法。结果显示,该方法仅对H1和H3亚型SIV呈特异性扩增,对H9亚型SIV、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(SFV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)无交叉扩增反应;用该方法检测H1和H3亚型SIV的HA基因的RNA标准对照(SIV-H1-RNA,SIV-H3-RNA),最适线性检测范围分别为3.7×10~1~3.7×10~8拷贝数/反应和3.4×10~0~3.4×10~8拷贝数/反应,最低检出限分别为38和34个拷贝数;该方法的组内试验和组间试验的变异系数均小于2.0%,显示其具有良好的可重复性。用该方法对520份进口猪的鼻拭子样本和78份国内猪鼻拭子样本进行SIV检测发现,进口猪鼻拭子样本的SIV检测结果均为阴性,12份国内猪鼻拭子样本的H1亚型SIV检测结果为阳性,5份国内猪鼻拭子样本的H3亚型SIV检测结果为阳性。本方法的建立为H1和H3亚型SIV检测提供了一种快速、敏感和特异的技术手段。

关 键 词:猪流感病毒  H1亚型  H3亚型  TaqMan探针  荧光RT-PCR

Development of a Duplex TaqMan-MGB Real-time RT-PCR Assay for Detecting H1 and H3 Subtype Swine Influenza Virus
Wang Jianhu,Chen Xiaojin,Zhang Junzhe,Wang Yuling,Xiao Yan,Zhao Dan,Tan Xufei,Wang Naifu,Chen Benlong,Dong Zhizhen,Zhao Xiaoping.Development of a Duplex TaqMan-MGB Real-time RT-PCR Assay for Detecting H1 and H3 Subtype Swine Influenza Virus[J].China Journal Of Animal Quarantine,2016,33(10):90-94.
Authors:Wang Jianhu  Chen Xiaojin  Zhang Junzhe  Wang Yuling  Xiao Yan  Zhao Dan  Tan Xufei  Wang Naifu  Chen Benlong  Dong Zhizhen  Zhao Xiaoping
Abstract:
Keywords:
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