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猪流行性腹泻焦磷酸测序检测方法的建立
引用本文:曹丙蕾,邱洪凯,孙涛,凌宗帅,张群.猪流行性腹泻焦磷酸测序检测方法的建立[J].中国动物检疫,2016,33(5):73-79.
作者姓名:曹丙蕾  邱洪凯  孙涛  凌宗帅  张群
基金项目:山东出入境检验检疫局科研项目(SK201401);动物病原微生物DNA条形码检测技术研究与示范应用(2012BAK11B04)
摘    要:本研究旨在建立一种基于RT-PCR的焦磷酸测序方法,以便对猪流行性腹泻(PED)进行高效准确地检测。利用PSQ Assay Design SW软件分析了猪流行性腹泻病毒(PEDV)N蛋白基因的保守区域,设计了一对扩增引物及一条测序引物,建立了PEDV N蛋白基因的焦磷酸测序检测方法。实验结果表明,该方法可以直接通过PSQ的序列结果直观地判定PEDV,大大提高了PEDV的检出率和准确性。该方法特异性强,不与其他猪源病毒发生交叉反应,最低核酸检测限为0.05 pg/μL。本研究所建立的焦磷酸测序方法灵敏度高、稳定性好,能从基因序列水平上精确鉴定PEDV,避免了假阳性结果的出现,对于PED的快速确诊具有重要意义。

关 键 词:猪流行性腹泻  猪流行性腹泻病毒  RT-PCR  焦磷酸测序  鉴定

Establishment of Pyrosequencing Assay Detection Method of Porcine Epidemic Diarrhea Virus
Cao Binglei,Qiu Hongkai,Sun Tao,Ling Zongshuai,Zhang Qun.Establishment of Pyrosequencing Assay Detection Method of Porcine Epidemic Diarrhea Virus[J].China Journal Of Animal Quarantine,2016,33(5):73-79.
Authors:Cao Binglei  Qiu Hongkai  Sun Tao  Ling Zongshuai  Zhang Qun
Abstract:
Keywords:
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