云南省野猪源猪瘟病毒E2及5'NTR基因序列测定分析

猪瘟（CSF）是由猪瘟病毒（CSFV）感染猪引起的一种急性、热性、接触性传染病，严重危害我国养猪业健康稳定发展。本研究采用RT-PCR方法，对从云南省宁洱县2头病死野猪体内分离到的2株CSFV毒株进行了E2及5''NTR基因扩增、克隆及序列测定；采用DNAMAN、MEGA6等分子生物学软件，对测得的序列与国内外参考毒株进行了同源性分析及系统发育分析。结果显示：2株野猪源CSFV株E2、5''NTR基因同源性分别为87.2%、100%，与国内外参考毒株同源性分别为81.0%~97.6%、93.6%~98.5%，与我国强毒株Shimen株的同源性分别为81.0%~81.2%、95.6%；2株野猪源CSFV毒株E2基因属于基因2.1亚型，5''NTR基因属于基因2.3亚型。氨基酸序列分析显示：其中一株分离毒株的E2基因有6个氨基酸具有2.1d分子变异特征，另一株兼有2.1d和2.1b亚型分支特征，可能是2.1b和2.1d亚型的过渡毒株。结果表明，云南省野猪源CSFV虽存在一定的遗传衍化，但总体比较稳定。本研究为云南省CSF防控提供了分子流行病学依据，为进一步做好分子变异等研究奠定了基础。

Sequencing and Analysis of E2 and 5'NTR Genes of CSFV Derived from Wild Boars in Yunnan Province