| 1株圆环病毒3型美国毒株全基因组克隆与遗传演化分析 |
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| 引用本文： | 郑晶,郝桂英,谢礼,安微,杨苗,陈瑛琪,张婧,郑巧,陈溪,陈孝宇,林华.1株圆环病毒3型美国毒株全基因组克隆与遗传演化分析[J].中国动物检疫,2022,39(1):116-123. |
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| 作者姓名： | 郑晶 郝桂英 谢礼 安微 杨苗 陈瑛琪 张婧 郑巧 陈溪 陈孝宇 林华 |
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| 作者单位： | 成都海关技术中心;西昌学院动物科学学院;大连海关技术中心;武汉海关技术中心 |
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| 基金项目： | 四川省科技计划项目（2020YFS0469）；海关总署科研项目（2019HK045） |
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| 摘 要： | 为了解进口美国种猪中获取的猪圆环病毒3型(PCV3)毒株全基因组序列及遗传变异情况,根据GenBank中收录的PCV3基因组序列,设计2对特异性引物,对确诊感染PCV3的病死猪组织进行全基因组序列扩增、拼接、测序和序列分析。结果显示,获得的PCV3美国毒株(命名为PCV3_USA2021,GenBank登录号OL799306)全基因组序列长度约为2000 bp,与国内外不同地区的38个PCV3参考毒株同源性为98.7%~99.8%。其中,PCV3_USA2021株开放阅读框ORF1和ORF2与国内外38个参考毒株同源性分别为99.1%~99.9%和98.0%~100%。构建的全基因组系统进化树显示,该毒株为PCV3a亚型,与美国毒株(PCV3-US_SD2016)亲缘关系最近。本研究为PCV3的遗传变异、流行病学分析提供了参考,也为相关疫苗的研制打下了基础。
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| 关 键 词： | 猪圆环病毒3型 全基因组克隆 遗传演化分析 CAP蛋白 美国毒株 |
Complete Genome Cloning and Genetic Evolution Analysis of an American Strain of Porcine Circovirus Type 3 |
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| Zheng Jing,Hao Guiying,Xie Li,An Wei,Yang Miao,Chen Yingqi,Zhang Jing,Zheng Qiao,Chen Xi,Chen Xiaoyu,Lin Hua.Complete Genome Cloning and Genetic Evolution Analysis of an American Strain of Porcine Circovirus Type 3[J].China Journal Of Animal Quarantine,2022,39(1):116-123. |
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| Authors: | Zheng Jing Hao Guiying Xie Li An Wei Yang Miao Chen Yingqi Zhang Jing Zheng Qiao Chen Xi Chen Xiaoyu Lin Hua |
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| Institution: | (Sichuan Key Laboratory of Food Safety Testing,Technology Center ofChengdu Customs,Chengdu,Sichuan 610041,China;School of Animal Sciences of Xichang University,Xichang,Sichuan 615013,China;Technology Center of Dalian Customs,Dalian,Liaoning 116014,China;Technology Center of Wuhan Customs,Wuhan,Hubei 430010,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PCV3 complete genome cloning analysis on genetic evolution Cap protein America strain |
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