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四川部分地区猪流行性腹泻的分子流行病学调查
引用本文:阳酉萍,黄小波,曹三杰,文心田,梁恩涛,张丹,张小会,段素芬,朱书全.四川部分地区猪流行性腹泻的分子流行病学调查[J].中国兽医学报,2015,35(5):704-710.
作者姓名:阳酉萍  黄小波  曹三杰  文心田  梁恩涛  张丹  张小会  段素芬  朱书全
作者单位:1. 四川农业大学动物医学学院动物传染病与基因芯片实验室,四川雅安,625014
2. 四川农业大学动物医学学院动物传染病与基因芯片实验室,四川雅安625014;四川农业大学人兽共患病研究室与猪病防治研究中心,四川成都611130
摘    要:本研究对四川猪流行性腹泻病毒(PEDV)开展了分子流行病学调查。参照毒株CV777的M基因序列,设计1对特异性引物(预期扩增大小为392bp),建立了快速检测PEDV的RT-PCR技术,对四川9个地区规模化猪场的75份仔猪腹泻病料进行检测与分析。再根据S基因的变异区域设计1对引物(扩增大小为947bp),选择扩增了四川9个地区的代表样品的S基因序列,并进行了进化与变异分析。结果显示,建立了检测PEDV的M基因的RT-PCR技术,并确定了最佳反应条件和反应体系,用该方法检测了四川75份腹泻病料,检出64份PEDV阳性,PEDV阳性检出率为86.67%,结果显示PEDV在四川地区发病季节除冬春季外,近年夏季也呈高发趋势。四川9株PEDV的S基因的核苷酸同源性为95.9%~100%,氨基酸同源性为95.1%~100%,四川毒株与14个国内外参考毒株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为84.6%~99.5%和84.2%~99.5%;四川流行毒株的S基因(S蛋白)存在碱基(氨基酸)缺失和插入现象。结果表明,本研究从分子流行病学角度证实了四川部分地区PEDV的流行与变异情况,为指导该地区PEDV科学防控提供了依据。

关 键 词:猪流行性腹泻  M基因  RT-PCR  S基因  分子流行病学  序列分析

Molecular epidemiological investigation porcine epidemic diarrhea in some areas of Sichuan
Abstract:
Keywords:Porcine epidemic diarrhea  RT-PCR  S gene  molecular epidemiology  investigation  Sequence Analysis
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