类禽H1N1亚型与Pdm/09H1N1亚型猪流感重组病毒的分离鉴定及其遗传进化分析 |
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引用本文: | 秦锋,蔡孟楷,黄俊明,方博,卜德新,罗永峰,付新亮,曹振鹏,马俊,张桂红.类禽H1N1亚型与Pdm/09H1N1亚型猪流感重组病毒的分离鉴定及其遗传进化分析[J].中国兽医学报,2018(1):113-120. |
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作者姓名: | 秦锋 蔡孟楷 黄俊明 方博 卜德新 罗永峰 付新亮 曹振鹏 马俊 张桂红 |
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作者单位: | 华南农业大学兽医学院广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室/国家生猪种业工程技术研究中心; |
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摘 要: | 为了解猪流感病毒(SIV)的流行情况,本试验在2014年10月-2015年9月期间在广东省各地区采集猪的鼻拭子和肺脏病料,将样品处理之后进行鸡胚分离和RT-PCR检测,分离到1株SIV,对其进行全基因组测序和遗传进化分析,结果表明为H1N1亚型SIV,病毒HA,NA,M和NS基因片段属于类禽分支(EA),病毒PB2、PB1、PA和NP基因片段属于Pdm/09分支。HA基因序列同源性结果显示,核苷酸相似性为93.2%~99.1%,其中与A/swine/Jiangxi/3858/2011(H1N1)SIV同源性最高。抗原位点分析结果表明,分离毒株的抗原位点基本保守。本研究通对广东省各地区分离的SIV分析,为SIV的重组和变异趋势及公共卫生安全的防控提供依据。
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关 键 词: | 猪流感病毒 RT-PCR 遗传进化分析 重组病毒 抗原位点 |
Isolation and genetic evolution analysis of reorganization swine influenza virus from eaH1N1SIV and pdm09H1N1 SIV |
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