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2006-2007年云南流行H9N2禽流感病毒血凝素全基因序列分析
引用本文:张泉鹏,李作生,张富强,李静,赵焕云,张文东,宋建领,鲍晓伟,邱薇,郑颖,范泉水.2006-2007年云南流行H9N2禽流感病毒血凝素全基因序列分析[J].中国兽医学报,2009,29(3).
作者姓名:张泉鹏  李作生  张富强  李静  赵焕云  张文东  宋建领  鲍晓伟  邱薇  郑颖  范泉水
作者单位:1. 云南农业大学,动物科学技术学院,云南,昆明,650201
2. 成都军区疾病预防控制中心,云南,昆明,650032
3. 云南省兽医防疫总站,云南,昆明,650051
4. 云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南,昆明,650224
基金项目:云南省重大科技攻关项目,军队重点项目 
摘    要:为调查云南省H9N2亚型禽流感病毒的分子流行病学情况,对2006年6月至2007年4月从云南省16地州随机采集了各种家禽、家猪的5 728份喉气管和口腔棉拭子样品进行RT-PCR检测,276份样品呈H9N2阳性.将具有代表性的17份阳性样品的HA全长基因序列测定和分析.结果表明:株间HA基因同源性为91%~100%,推导氨基酸同源性95%~100%,所测序列与云南1999年分离H9N2毒株ackynkenxie-1-99的同源性仅为93%.根据HA基因同源性,可将17个毒株可分为2个亚群,一个亚群的12株HA基因同源性高达97%以上,与Qa/ST3143/05和C/Bei1/94同源性是97%和93%,其中的11株毒株HA基因全长1 671,编码556aa,存在第6~9位4 aa缺失,只有AC/Yndq/06株HA基因1 683.编码560 aa.另外一个亚群的其余5株,同源性98%以上,HA基因全长1683 bp,编码560 aa.17个毒株中3个存在218~220 aa糖基化位点变异,1个毒株551~553 as糖基化位点发生变异.所有毒株在HA裂解位点处没有连续性碱性氨基酸插入,受体结合位点处的氨基酸没有变异.

关 键 词:H9N2亚型禽流感病毒  HA基因  序列分析

Monitoring and sequence analysis of HA genes of H9N2 subtype influenza virus in YunNan province from 2006-2007
ZHANG Quan-peng,LI Zuo-sheng,ZHANG Fu-qiang,LI Jing,ZHAO Huan-yun,ZHANG Wen-dong,SONG Jian-ling,BAO Xiao-wei,QIU Wei,ZHENG Ying,FAN Quan-shui.Monitoring and sequence analysis of HA genes of H9N2 subtype influenza virus in YunNan province from 2006-2007[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2009,29(3).
Authors:ZHANG Quan-peng  LI Zuo-sheng  ZHANG Fu-qiang  LI Jing  ZHAO Huan-yun  ZHANG Wen-dong  SONG Jian-ling  BAO Xiao-wei  QIU Wei  ZHENG Ying  FAN Quan-shui
Abstract:
Keywords:
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