犬瘟热病毒N蛋白的B细胞抗原表位预测 |
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引用本文: | 张海雷,白换力,薛慧亮,李志萍,苏红艳,唐志文,靳朝,夏志平.犬瘟热病毒N蛋白的B细胞抗原表位预测[J].中国兽医学报,2014(1):10-16. |
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作者姓名: | 张海雷 白换力 薛慧亮 李志萍 苏红艳 唐志文 靳朝 夏志平 |
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作者单位: | ;1.吉林大学动物医学学院;2.军事医学科学院军事兽医研究所 |
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摘 要: | 将1段犬瘟热病毒N蛋白氨基酸序列(GenBank编号为:AEV77096.1)与Gen Bank登录的其他氨基酸序列进行比对,分析其同源性;通过DNAStar生物信息学分析软件中的Protean模块及The PredictProtein server在线蛋白分析工具预测犬瘟热病毒N蛋白的理化性质、二级结构、亲水性、表面可及性、柔韧性、抗原指数、跨膜螺旋、蛋白相互作用位点、蛋白功能位点等特性,并预测其B细胞优势抗原表位。结果显示,犬瘟热病毒N蛋白具有规则的二级结构、亲水性、柔韧性片段多,多处于表面可及性大,抗原指数高,蛋白质相互作用位点区域。潜在的B细胞优势抗原表位为1218、6118、6166、24366、243246、410246、410415、421415、421429、434429、434447、452447、452456、480456、480487氨基酸序列。结果表明,本试验预测了犬瘟热病毒N蛋白的B细胞优势抗原表位,为进一步设计犬瘟热病毒的诊断抗原多肽、免疫用抗原多肽和研发血清学检测试剂盒奠定了理论基础。
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关 键 词: | 犬瘟热病毒 生物信息学 B细胞抗原表位 |
Prediction of antigenic epitopes of canine distemper virus N protein |
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