用3′RACE方法扩增并克隆口蹄疫病毒基因组3′末端序列 |
| |
引用本文: | 刘光清,刘在新,谢庆阁.用3′RACE方法扩增并克隆口蹄疫病毒基因组3′末端序列[J].中国兽医学报,2003(6). |
| |
作者姓名: | 刘光清 刘在新 谢庆阁 |
| |
作者单位: | 中国农业科学院兰州兽医研究所农业部畜禽病毒学重点实验室 甘肃兰州730046
(刘光清,刘在新),中国农业科学院兰州兽医研究所农业部畜禽病毒学重点实验室 甘肃兰州730046(谢庆阁) |
| |
基金项目: | 国家“973”项目 (G19990 1190 1) |
| |
摘 要: | 应用 3′RACE方法扩增并克隆了口蹄疫病毒 ( FMDV) OH99株基因组 3′端真实序列。测序结果表明 ,所扩增的目的基因片段长 15 0 0 nt,包括 3D基因部分序列、3′端非编码区 ( Non- Coding Region,NCR)和 Poly( A)尾巴 ,其中 3′NCR位于终止密码子 TAA之后 ,长 93nt,Poly( A)尾序列至少含有 5 6个 A。与参考毒株进行序列比较 ,结果显示 ,OH99株与 OTY TW/ 97株的核苷酸同源性较高 ,为 91.4 % ,而与 O1K、CHINA99、A12等毒株的核苷酸同源性较低 ,其同源性分别为 6 8.1%、71.0 %、70 .2 %。 3′NCR的末端存在保守性较高的基序 :CCCTCAGATG,TTTTCCC-CGCTTCCT。本研究为进一步研究 FMDV基因组的功能、构建 OH99株的反向遗传操作系统奠定了基础。
|
关 键 词: | 3′RACE 口蹄疫病毒 3′端非编码区 Poly(A) 序列分析 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
|