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青海省格尔木牦牛的母系遗传多样性及支系组成
引用本文:白诗睿,马志杰,李广祯,杨振菲,陈生梅,谢银禄,郭东风,陈立.青海省格尔木牦牛的母系遗传多样性及支系组成[J].中国牛业科学,2022,48(2):33-38.
作者姓名:白诗睿  马志杰  李广祯  杨振菲  陈生梅  谢银禄  郭东风  陈立
作者单位:青海大学畜牧兽医科学院,青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室,西宁810016,青海省格尔木市畜牧兽医站,青海格尔木816000,青海省格尔木市唐古拉山镇兽医站,青海格尔木816099
基金项目:(31960656);中国科学院“西部之光”人才培养引进计划(“西部青年学者”)项目(3-1)
摘    要:目的]从分子水平上探究青海省格尔木牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构及其遗传背景。方法]对49头格尔木牦牛mtDNA D-loop区部分序列进行了测定,后使用DnaSP 5.10.01、Arlequin 3.11和MEGA 5.05等生物信息学软件确定其多态位点和单倍型数目,计算核苷酸多样度和单倍型多样度大小,并进行系统发育分析。结果]在截取的618 bp格尔木牦牛D-loop区分析序列中,排除1处插入(缺失)后共检测到45处多态位点,包括10处单一多态位点和35处简约信息位点;根据序列间核苷酸变异共确定了18种单倍型,其中单倍型H4为优势单倍型,核苷酸多样度为0.015±0.008,单倍型多样度为0.911±0.022。与野牦牛及大通、天祝、金川等其他家牦牛品种相比,格尔木牦牛群体单倍型多样度和核苷酸多样度值均较高,表明该群体具有丰富的母系遗传多样性。以美洲野牛为外群,邻接法(即NJ法)构建的系统发育树结果显示:格尔木牦牛群体18种单倍型分布在A、B、C、D和G 5种单倍型组中,且聚为3个大的分支,提示格尔木牦牛由3个母系支系组成,拥有3个母系起源。结论]格尔木牦牛群体具有丰...

关 键 词:格尔木牦牛  mtDNA  D-loop区  母系遗传多样性  支系组成
收稿时间:2021/11/23 0:00:00
修稿时间:2021/11/30 0:00:00

Maternal Genetic Diversity and Lineage Composition of Golmud Yak Population in Qinghai Province, China
Bai Shirui,Ma Zhijie,Li Guangzhen,Yang Zhenfei,Chen Shengmei,Xie Yinlu,Guo Dongfeng and Chen Li.Maternal Genetic Diversity and Lineage Composition of Golmud Yak Population in Qinghai Province, China[J].China Cattle Science,2022,48(2):33-38.
Authors:Bai Shirui  Ma Zhijie  Li Guangzhen  Yang Zhenfei  Chen Shengmei  Xie Yinlu  Guo Dongfeng and Chen Li
Institution:Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University,Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University,Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University,Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University,Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University,Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University,Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University,Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Qinghai University
Abstract:
Keywords:Golmud yak  mtDNA  D-loop region  Maternal genetic diversity  Lineage composition
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