全基因组水平白花草木樨TCP基因家族的鉴定及在干旱胁迫下表达模式分析 |
| |
引用本文: | 李艳鹏,魏娜,翟庆妍,李杭,张吉宇,刘文献.全基因组水平白花草木樨TCP基因家族的鉴定及在干旱胁迫下表达模式分析[J].草业学报,2023(4):101-111. |
| |
作者姓名: | 李艳鹏 魏娜 翟庆妍 李杭 张吉宇 刘文献 |
| |
作者单位: | 兰州大学草种创新与草地农业生态系统全国重点实验室兰州大学草地农业教育部工程研究中心甘肃省西部草业技术创新中心兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室兰州大学草地农业科技学院 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金-国际(地区)合作与交流项目(32061143035)资助; |
| |
摘 要: | 草木樨是我国北方地区重要的饲料与绿肥豆科作物,在我国草牧业发展和生态经济建设中具有重要作用。干旱胁迫是影响草木樨分布和产量的重要因素,筛选和鉴定调控草木樨响应干旱胁迫的基因对解析草木樨抗旱生物学研究具有重要意义。TCP(teosinte branches1/cycloidea/pro-liferating cell factory)是一类植物特有的转录因子,在调控植物响应干旱胁迫过程中具有重要作用,但目前该基因家族在草木樨中的分布以及响应干旱胁迫的生物学功能未见报道。本研究以白花草木樨为对象,利用生物信息学方法在全基因组水平对TCP基因家族进行系统鉴定,并对其基因结构、系统进化、染色体定位以及干旱胁迫下表达模式进行了分析。结果表明,白花草木樨含有18个MaTCP基因,不均匀地分布在6条染色体上。系统进化表明,18个MaTCP基因可以分为TCP-P和TCP-C两大亚家族,其中TCP-P仅包含PCF分支,而TCP-C包含CYC/TB1与CIN两个分支。这些基因都含有高度保守的bHLH结构域,同亚家族中的成员具有相似的保守基序与基因结构,但在bHLH结构域中TCP-P亚家族相较于TCP-C亚...
|
关 键 词: | 白花草木樨 TCP基因 全基因组鉴定 干旱胁迫 表达模式 |
|